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3D深層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可精確重建自由行為的動物動作

導(dǎo)讀 動物不斷響應(yīng)大腦的指令而運(yùn)動。但是,盡管有先進(jìn)的技術(shù)可以根據(jù)神經(jīng)活動來測量這些指令,但仍缺乏用于量化自由移動動物自身行為的技術(shù)。這

動物不斷響應(yīng)大腦的指令而運(yùn)動。但是,盡管有先進(jìn)的技術(shù)可以根據(jù)神經(jīng)活動來測量這些指令,但仍缺乏用于量化自由移動動物自身行為的技術(shù)。這種無法測量大腦關(guān)鍵輸出的能力限制了我們對神經(jīng)系統(tǒng)及其在疾病中的變化的理解。

杜克大學(xué)和哈佛大學(xué)研究人員的一項(xiàng)新研究引入了一種自動化工具,該工具可以輕松捕獲行為自由的動物的行為,并通過單個(gè)攝像機(jī)精確地重建其三維(3D)姿態(tài),而無需標(biāo)記。

杜克大學(xué)助理教授蒂莫西·鄧恩(Timothy W. Dunn)和哈佛大學(xué)博士后研究員杰西·馬歇爾(Jesse D.Marshall)在4月19日進(jìn)行的《自然方法》研究中,描述了一種新的3D深層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)DANNCE(3維對齊神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),用于計(jì)算民族學(xué))。該研究是該團(tuán)隊(duì)于2020年在Neuron中進(jìn)行的研究的結(jié)果,該研究揭示了突破性的行為監(jiān)控系統(tǒng)CAPTURE(使用后向反射器嵌入的連續(xù)附錄和姿勢跟蹤),該系統(tǒng)使用運(yùn)動捕捉和深度學(xué)習(xí)來連續(xù)跟蹤自由行為動物的3D運(yùn)動。捕捉對動物的行為產(chǎn)生了前所未有的詳細(xì)描述。但是,它需要使用專門的硬件并將標(biāo)記物附加到動物上,這給使用帶來了挑戰(zhàn)。

Dunn說:“有了DANNCE,我們可以減輕這一要求。”“ DANNCE即使在看不見的情況下也可以學(xué)會跟蹤身體部位,這增加了可以使用該技術(shù)的環(huán)境的類型。我們需要這種不和靈活性來測量自然環(huán)境中的運(yùn)動,以更有可能激發(fā)出完整的感覺。以及這些動物的行為舉止復(fù)雜。”

DANNCE可在廣泛的物種中工作,并且可在實(shí)驗(yàn)室和環(huán)境中重現(xiàn),從而確保其對動物乃至人類的行為研究具有廣泛的影響。它具有專門的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),專門用于從視頻進(jìn)行3D姿勢跟蹤。一個(gè)關(guān)鍵方面是其3D特征空間以物理單位(米)而不是相機(jī)像素為單位。這使該工具可以更容易地在不同的相機(jī)布置和實(shí)驗(yàn)室之間進(jìn)行歸納。相反,以前的3D姿態(tài)跟蹤方法使用的是經(jīng)過量身定制的二維(2D)姿態(tài)檢測神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)難以適應(yīng)新的3D視點(diǎn)。

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