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基于深度學(xué)習(xí)的組織虛擬染色有助于快速評估乳腺癌生物標(biāo)志物

乳腺癌是全球女性癌癥死亡的主要原因之一。在診斷出乳腺癌后,會常規(guī)進(jìn)行 HER2(一種促進(jìn)癌細(xì)胞生長的蛋白質(zhì))的測試,以幫助評估癌癥預(yù)后并制定針對 HER2 的治療計劃。

標(biāo)準(zhǔn)的 HER2 測試程序包括進(jìn)行乳房活檢,將組織標(biāo)本制備成薄的顯微鏡載玻片,用突出 HER2 蛋白的特定化學(xué)試劑對載玻片進(jìn)行染色/染色,并在光學(xué)顯微鏡下檢查染色的載玻片以提供病理報告。

然而,這種標(biāo)準(zhǔn)的 HER2 染色程序成本高且周轉(zhuǎn)時間長,因為染色過程需要由專家在專用實驗室設(shè)施中執(zhí)行費力的樣品處理步驟(通常約 24 小時)。

在最近發(fā)表在BME Frontiers上的一項工作中,加州大學(xué)洛杉磯分校的一個研究小組開發(fā)了一種由深度學(xué)習(xí)提供支持的計算染色方法,該方法無需任何化學(xué)物質(zhì)即可執(zhí)行 HER2 染色。研究小組捕獲了未染色乳房組織的自發(fā)熒光信息,這些信息是生物結(jié)構(gòu)在吸收光時自然發(fā)出的。

他們進(jìn)一步訓(xùn)練了一個深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)可以將這些無染色的自發(fā)熒光圖像快速轉(zhuǎn)換為虛擬組織學(xué)圖像,顯示準(zhǔn)確的顏色和對比度,就好像組織切片經(jīng)過 HER2 化學(xué)染色一樣。這種計算染色過程每個樣品只需幾分鐘,不需要昂貴的設(shè)施或有毒化學(xué)品。僅使用計算機(jī),HER2 染色就可以更快、更經(jīng)濟(jì)地完成,從而加速乳腺癌的評估和治療。

董事會認(rèn)證的病理學(xué)家盲目地驗證了這種基于 AI 的虛擬 HER2 染色技術(shù)的診斷價值和染色質(zhì)量。病理學(xué)家證實,深度學(xué)習(xí)生成的圖像為 HER2 評估提供了同等的診斷準(zhǔn)確性,并且染色質(zhì)量與實驗室化學(xué)染色的標(biāo)準(zhǔn)圖像相當(dāng)。

這種基于深度學(xué)習(xí)的虛擬 HER2 染色方法無需組織學(xué)專家執(zhí)行昂貴、費力和耗時的 HER2 染色程序,并可擴(kuò)展到其他癌癥相關(guān)生物標(biāo)志物的染色,以加速臨床中的傳統(tǒng)組織病理學(xué)和診斷工作流程設(shè)置。

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