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幾分鐘內(nèi)小分子從燒杯到溶液的三維結(jié)構(gòu)

導(dǎo)讀 在一項(xiàng)新的研究中,一位科學(xué)家稱之為令人瞠目結(jié)舌。加州大學(xué)洛杉磯分校 加州理工學(xué)院聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)證明,只需要30分鐘就能得到小分子的

在一項(xiàng)新的研究中,一位科學(xué)家稱之為令人瞠目結(jié)舌。加州大學(xué)洛杉磯分校/加州理工學(xué)院聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)證明,只需要30分鐘就能得到小分子的結(jié)構(gòu),比如一些激素和藥物。這比以前少了幾天甚至幾天。

該團(tuán)隊(duì)使用了一種叫做微電子衍射(MicroED)的技術(shù),用于研究更大分子的三維結(jié)構(gòu),尤其是蛋白質(zhì)。在這項(xiàng)新的研究中,研究人員表明,這項(xiàng)技術(shù)可以應(yīng)用于小分子,并且這一過(guò)程的準(zhǔn)備時(shí)間遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于預(yù)期。與相關(guān)技術(shù)不同——其中一些技術(shù)涉及鹽粒大小的晶體生長(zhǎng)——正如新的研究證明的那樣,這種方法可以用于普通的起始樣品,有時(shí)甚至可以從燒杯的側(cè)面刮下粉末。發(fā)表在《ACS Central Science》雜志上的這項(xiàng)新研究的合著者、加州理工學(xué)院化學(xué)教授布萊恩斯托爾茨(Brian Stoltz)說(shuō),“我們使用了你能得到的最低樣本,幾乎在任何時(shí)候都獲得了最高質(zhì)量的結(jié)構(gòu)?!?。"當(dāng)我第一次看到結(jié)果時(shí),我的下巴撞到了地板上。"本文于10月中旬首次在預(yù)打印服務(wù)器Chemrxiv上發(fā)布,已被瀏覽超過(guò)3.5萬(wàn)次。

這種方法在小分子樣品上運(yùn)行良好的原因是,盡管樣品看起來(lái)像簡(jiǎn)單的粉末,但它們實(shí)際上包含微小的晶體,每個(gè)晶體比少量的灰塵小大約10億倍。研究人員以前就知道這些隱藏的微晶,但他們沒(méi)有意識(shí)到它們可以很容易地用MicroED揭示晶體的分子結(jié)構(gòu)。斯托爾茨說(shuō):“我認(rèn)為人們沒(méi)有意識(shí)到這些微晶在粉末樣品中有多常見(jiàn)?!斑@就像科幻小說(shuō)。我不認(rèn)為這種情況會(huì)發(fā)生在我的生活中——你可以看到粉末結(jié)構(gòu)?!?

這些結(jié)果對(duì)于想要確定小分子結(jié)構(gòu)的化學(xué)家來(lái)說(shuō)是有意義的,小分子被定義為重量小于約900道爾頓的小分子。道爾頓是氫原子的重量。這些微小的化合物包括一些在自然界中發(fā)現(xiàn)的化學(xué)物質(zhì),一些生物物質(zhì),如激素,以及許多治療藥物。MicroED結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)方法可能的應(yīng)用包括藥物發(fā)現(xiàn)、實(shí)驗(yàn)室分析、醫(yī)學(xué)檢測(cè)等。例如,斯托爾茨說(shuō),這種方法可能用于在運(yùn)動(dòng)員中測(cè)試最新的提高成績(jī)的藥物,其中可能只存在微量的化學(xué)物質(zhì)。

“制造新分子最慢的一步是確定產(chǎn)品的結(jié)構(gòu)。加州理工學(xué)院的羅伯特格拉布、維克多和伊麗莎白阿特金斯化學(xué)教授說(shuō):“現(xiàn)在可能不再是這樣了,因?yàn)檫@項(xiàng)技術(shù)有望徹底改變有機(jī)化學(xué)。2005年獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),沒(méi)有參與這項(xiàng)研究?!霸诖酥埃Y(jié)構(gòu)測(cè)定的最后一個(gè)重大突破是核磁共振波譜,它是由加州理工學(xué)院的杰克羅伯茨在20世紀(jì)60年代末引入的?!毕衿渌铣苫瘜W(xué)家一樣,斯托爾茨和他的團(tuán)隊(duì)花時(shí)間試圖找出如何在實(shí)驗(yàn)室中使用基本原材料組裝化學(xué)物質(zhì)。他們的實(shí)驗(yàn)室專注于天然小分子,如真菌中的-內(nèi)酰胺,與青霉素有關(guān)。為了構(gòu)建這些化學(xué)物質(zhì),他們需要確定反應(yīng)中分子的結(jié)構(gòu)——中間分子和最終產(chǎn)物——以確定它們是否在正確的軌道上。

一種技術(shù)是x光結(jié)晶學(xué),化學(xué)樣品被x光擊中,x光衍射它們的原子;那些x光衍射圖揭示了目標(biāo)化學(xué)物質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。通常,這種方法用于求解真實(shí)大分子的結(jié)構(gòu),如復(fù)雜的膜蛋白,但也可以應(yīng)用于小分子。挑戰(zhàn)在于,為了實(shí)施這種方法,化學(xué)家必須從樣品中制造出合適尺寸的晶體塊,這并不總是那么容易。斯托茨說(shuō):“我花了幾個(gè)月的時(shí)間試圖為我的一個(gè)樣品購(gòu)買(mǎi)合適的晶體。另一種可靠的方法是核磁共振(NMR),它不需要晶體,但需要相對(duì)大量的樣品,這可能很難積累。此外,核磁共振只提供間接的結(jié)構(gòu)信息。

以前,micro id-類似于X射線結(jié)晶學(xué),但使用電子代替X射線-主要用于結(jié)晶蛋白質(zhì),而不是小分子。合著者塔米爾戈寧是加州大學(xué)洛杉磯分校的電子晶體學(xué)家,他開(kāi)始在弗吉尼亞州的霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究蛋白質(zhì)的微電泳技術(shù)。他說(shuō),在加入加州大學(xué)洛杉磯分校并與之合作后,他開(kāi)始考慮在小分子上使用這種方法。加州理工學(xué)院加州大學(xué)洛杉磯分?;瘜W(xué)和生物化學(xué)助理教授Hosea Nelson(博士' 13)說(shuō):“Tamir一直在將這項(xiàng)技術(shù)用于蛋白質(zhì),只是提到有時(shí)他們只能使用粉末狀的蛋白質(zhì)樣本來(lái)使用它?!拔业念^腦被這個(gè)吹走了,你不需要生長(zhǎng)晶體,然后團(tuán)隊(duì)開(kāi)始意識(shí)到我們可以把這個(gè)方法應(yīng)用到一類全新的分子上,這對(duì)所有類型的化學(xué)都有廣泛的影響?!?

該團(tuán)隊(duì)測(cè)試了幾個(gè)不同質(zhì)量的樣品,沒(méi)有試圖結(jié)晶它們,并且可以確定它們的結(jié)構(gòu),因?yàn)闃悠分杏胸S富的微晶。他們成功地獲得了品牌藥物泰諾和Advil的研磨樣品的結(jié)構(gòu),并且他們能夠從四種化學(xué)物質(zhì)的粉末混合物中識(shí)別不同的結(jié)構(gòu)。加州大學(xué)洛杉磯分校/加州理工學(xué)院團(tuán)隊(duì)表示,希望這種方法將成為未來(lái)化學(xué)實(shí)驗(yàn)室的常規(guī)方法。斯托爾茨說(shuō):“在我們的實(shí)驗(yàn)室里,每天都有學(xué)生和博士后研究人員在制作全新獨(dú)特的分子實(shí)體?!艾F(xiàn)在我們有能力快速找出它們是什么。這將改變合成化學(xué)?!?

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