由慕尼黑工業(yè)大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)由 37 名科學(xué)家組成的研究小組開發(fā)了一種方法，可以以時(shí)間和劑量依賴的方式檢測藥物誘導(dǎo)的翻譯后修飾 (PTM)。
這項(xiàng)發(fā)表在《科學(xué)》雜志上的研究詳細(xì)介紹了一種方法，該方法更接近地模擬藥物蛋白與細(xì)胞中的蛋白質(zhì)相互作用時(shí)細(xì)胞中發(fā)生的情況。翻譯后修飾 (PTM) 是影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和動(dòng)力學(xué)的處理事件。
由于蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與其功能相關(guān)，因此修飾可以顯著改變生物過程，這也是大多數(shù)藥物設(shè)計(jì)的運(yùn)作方式。雖然藥物/細(xì)胞蛋白相互作用已廣為人知，但這種相互作用在治療過程中究竟如何發(fā)生(時(shí)間和劑量依賴性)仍是一個(gè)未被充分研究的方面。
稱為 decryptM 的蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法涉及用濃度不斷增加的藥物處理細(xì)胞并量化數(shù)以千計(jì)的藥物 PTM 以揭示目標(biāo)參與和藥物作用機(jī)制。
在這項(xiàng)研究中，decryptM 分析應(yīng)用于13 種細(xì)胞系中的 31 種抗癌藥物。來自該方法的數(shù)據(jù)代表了 180 萬個(gè)具有劑量反應(yīng)曲線的定量細(xì)胞藥物測定，其中在 11,982 種蛋白質(zhì)上檢測到 124,660 種調(diào)節(jié)磷酸肽，在 3,006 種蛋白質(zhì)上檢測到 9,173 種泛素化肽，在 1,377 種蛋白質(zhì)上檢測到 2,478 種調(diào)節(jié)乙酰化肽。
大多數(shù) PTM 不受大多數(shù)??藥物的監(jiān)管，這是了解每種藥物正在使用或可能遺漏哪些途徑的寶貴信息。
對于兩種蛋白酶體抑制劑藥物硼替佐米和卡非佐米，decryptM 數(shù)據(jù)顯示藥物作用隨著時(shí)間的推移變得更加有效，并表明調(diào)節(jié)磷酸化位點(diǎn)的增加是一種可能的機(jī)制。
該研究還發(fā)現(xiàn)，不同的組蛋白脫乙酰酶抑制劑(抗癌劑)具有不同的激活時(shí)間，并且藥物的特定靶點(diǎn)比其他藥物更有效。這種類型的信息可以極大地有益于尋求提高現(xiàn)有藥物有效性的研究人員。
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