切爾諾夫大學(xué)的研究人員與俄羅斯一些研究所的同事一起,分析了蜱傳腦炎病毒的核糖核酸結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。
新的數(shù)據(jù)比以前的研究大得多,這使他們能夠估計病毒亞型的年齡,并跟蹤它們在歐亞的傳播。研究結(jié)果發(fā)表在《病毒》雜志上。
Ick腦炎在中歐和東歐很常見,在西伯利亞南部和遠(yuǎn)東也很常見。
因為病毒可以穿透大腦和脊髓,引起運動障礙、認(rèn)知障礙,嚴(yán)重者甚至癱瘓死亡,這種疾病是危險的。在俄羅斯,每年有1500-2000人感染,其中約30%患有神經(jīng)系統(tǒng)并發(fā)癥,20-100人死亡。
該病原體屬于黃病毒(包括寨卡病毒和登革病毒),主要通過蜱叮咬傳播。病毒分為三個亞型:遠(yuǎn)東、西伯利亞和歐洲。
它們中的每一個都在其命名區(qū)域占主導(dǎo)地位,盡管這種劃分相當(dāng)粗略——例如,在波羅的海國家和庫頁島以及歐洲人中,已經(jīng)觀察到西伯利亞亞型感染病例——朝鮮和阿爾泰山。
近年來,病毒的傳播已經(jīng)蔓延到北部地區(qū)(科拉半島、阿爾漢格爾斯克地區(qū))和山區(qū)(中歐和)。2019年,英國和荷蘭記錄了首批感染病例。
為了快速應(yīng)對新領(lǐng)域病毒的出現(xiàn),有必要了解影響其傳播和進(jìn)化的因素?,F(xiàn)有的研究提供了不同的、有時是矛盾的結(jié)果,但近年來收集的新數(shù)據(jù)可以澄清這種情況。
本文作者使用的是GenBank——一個存儲了2億多種物種的RNA和DNA核苷酸序列的數(shù)據(jù)庫。
數(shù)據(jù)由不同國家的科學(xué)家提供,描述腦炎病毒RNA的序列數(shù)量是一樣的,而且數(shù)量還在增加——十年間,數(shù)量增加了5倍。
研究人員使用計算機(jī)算法來比較不同國家不同年份發(fā)現(xiàn)的病毒RNA。
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