倫敦大學(xué)學(xué)院研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)新研究發(fā)現(xiàn)，針對(duì)個(gè)體患者定制全基因組測(cè)序分析可以使罕見(jiàn)病的診斷率翻倍。
2018 年，英國(guó)衛(wèi)生部宣布了一項(xiàng) NHS 基因組醫(yī)學(xué)服務(wù)，該服務(wù)允許罕見(jiàn)病患者讀取其整個(gè)遺傳密碼，以期提供急需的診斷。
然而，對(duì)這些數(shù)據(jù)的解釋可能極具挑戰(zhàn)性，許多患有復(fù)雜、罕見(jiàn)的遺傳病的人仍然沒(méi)有得到解決其問(wèn)題原因的分子答案。
在這項(xiàng)發(fā)表在《自然通訊》上的研究中，倫敦大學(xué)學(xué)院皇后廣場(chǎng)神經(jīng)病學(xué)研究所倫敦線粒體中心和倫敦大學(xué)學(xué)院大奧蒙德街兒童健康研究所的研究人員試圖為這些患者提供更好的接受基因診斷的機(jī)會(huì)。
為此，他們測(cè)試了如何使用由專(zhuān)科醫(yī)生、生物信息學(xué)家和科學(xué)家組成的基因組醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)來(lái)提高 NHS 診斷實(shí)驗(yàn)室的能力，使其超越標(biāo)準(zhǔn)的半自動(dòng)數(shù)據(jù)分析。UCL 團(tuán)隊(duì)重新評(píng)估了未確診的病例，以確定可能有助于指導(dǎo)進(jìn)一步、更個(gè)性化分析的線索。他們隨后應(yīng)用了額外的生物信息學(xué)方法，使用先進(jìn)的計(jì)算機(jī)技術(shù)來(lái)識(shí)別患者 DNA 中可能導(dǎo)致疾病但在常規(guī)測(cè)試中被忽視的基因改變。
這項(xiàng)工作包括 102 名未確診的患者，他們懷疑患有原發(fā)性線粒體疾病(群影響兒童和成人的無(wú)法治愈的遺傳疾病，與廣泛的醫(yī)療問(wèn)題、嚴(yán)重殘疾和壽命縮短有關(guān))，他們經(jīng)歷了全基因組通過(guò) NHS 的 100,000 基因組計(jì)劃進(jìn)行測(cè)序。
這種個(gè)性化的方法將診斷率從 16.7% 提高到 31.4%。它還在另外 3.9% 的患者中檢測(cè)到潛在的致病變異。
主要作者 Robert Pitceathly 博士(倫敦 NHS 罕見(jiàn)線粒體疾病高度專(zhuān)業(yè)化服務(wù)的聯(lián)合負(fù)責(zé)人，倫敦大學(xué)學(xué)院皇后廣場(chǎng)神經(jīng)病學(xué)研究所的研究小組負(fù)責(zé)人)說(shuō)：“NHS 在先進(jìn)的基因技術(shù)上投入了大量資金。因此，英國(guó)已經(jīng)確立了自己在診斷全基因組測(cè)序的最前沿。也就是說(shuō)，一些患有罕見(jiàn)遺傳病的人在對(duì)其基因組進(jìn)行分析后仍然沒(méi)有進(jìn)行分子診斷。
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