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CRISPR 和單細胞測序可確定性狀和疾病的因果遺傳變異

導讀 人類遺傳學的一個主要挑戰(zhàn)是了解基因組的哪些部分驅(qū)動特定特征或?qū)е录膊★L險。對于在不編碼蛋白質(zhì)的 98% 的基因組中發(fā)現(xiàn)的遺傳變異,這

人類遺傳學的一個主要挑戰(zhàn)是了解基因組的哪些部分驅(qū)動特定特征或?qū)е录膊★L險。對于在不編碼蛋白質(zhì)的 98% 的基因組中發(fā)現(xiàn)的遺傳變異,這一挑戰(zhàn)甚至更大。

紐約大學和紐約基因組中心的研究人員開發(fā)的一種新方法結(jié)合了遺傳關聯(lián)研究、基因編輯和單細胞測序,以應對這些挑戰(zhàn)并發(fā)現(xiàn)血細胞特征的因果變異和遺傳機制。

他們的方法被稱為 STING-seq 并發(fā)表在《科學》雜志上,解決了將遺傳變異與人類特征和健康直接聯(lián)系起來的挑戰(zhàn),并可以幫助科學家確定具有遺傳基礎的疾病的藥物靶點。

在過去的二十年里,全基因組關聯(lián)研究(GWAS)已經(jīng)成為研究人類基因組的重要工具。使用 GWAS,科學家們已經(jīng)確定了與許多疾病相關的數(shù)千種基因突變或變異,從精神分裂癥到糖尿病,以及身高等特征。這些研究是通過比較大量人群的基因組來進行的,以發(fā)現(xiàn)在具有特定疾病或特征的人群中更常發(fā)生的變異。

GWAS 可以揭示哪些基因組區(qū)域和潛在變異與疾病或性狀有關。然而,這些關聯(lián)幾乎總是存在于不編碼蛋白質(zhì)的 98% 的基因組中,這遠不如對編碼蛋白質(zhì)的 2% 的基因組進行深入研究。更復雜的是,在基因組中發(fā)現(xiàn)許多變體彼此非常接近,并且世代相傳,這一概念稱為連鎖。這使得很難區(qū)分哪個變體與附近的其他變體起著真正的因果作用。即使科學家能夠確定哪個變異導致疾病或性狀,他們也并不總是知道該變異會影響哪個基因。

“研究人類疾病的一個主要目標是確定致病基因和變異,這可以闡明生物學機制并為這些疾病提供藥物靶標,”紐約大學生物學副教授、神經(jīng)科學和生理學副教授 Neville Sanjana 說。紐約大學格羅斯曼醫(yī)學院,紐約基因組中心的核心教員,也是該研究的共同資深作者。

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