分子相互作用的方式構成了生命和治療疾病的基礎。但是，當病毒蛋白與藥物中的分子相遇并結合時，它會是什么樣子的呢?歐洲研究理事會已經(jīng)資助了65萬丹麥克朗，現(xiàn)在旨在揭示這一迄今為止看不見的過程。
團隊成員在項目規(guī)劃期間休息。圖中：隆德大學的MikaelAkke，哥本哈根大學的KrestenLindorff-Larsen和漢堡埃彭多夫大學醫(yī)學中心的Eike-ChristianSchulz。照片：朱利奧·特塞
蛋白質對于使生命成為可能的每個過程都是必不可少的。因此，了解它們的工作原理至關重要。例如，當它們允許藥物通過與組成藥物的分子結合而起作用時。到目前為止，這是一個至關重要的過程，幾乎不可能通過實驗直接觀察到，盡管已經(jīng)努力使用有點僵化的計算機模型來模仿它。
我們目前將蛋白質描述為靜態(tài)分子限制了我們理解它們的能力。它們在不同狀態(tài)之間自發(fā)過渡，其中一些運動很少見，傳統(tǒng)研究方法通常看不見。這項研究項目將為看不見的過程提供新的線索，以便我們對它們有更深入的了解，以及當一種蛋白質與另一種分子結合時會發(fā)生什么。
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實際上，研究人員將研究HIV和SARS-CoV-2等病毒中的蛋白質如何與細胞中天然存在的分子結合，就像藥物中的分子一樣。目的是繪制蛋白質的結構和能量在結合過程中如何變化。
為了研究蛋白質世界中這些微小的結合過程，有必要結合幾種測量方法，每個參與的研究團隊都是其中的專家。生物系正在提供分子模擬和其他計算工具，隆德大學正在進行核磁共振波譜學，漢堡擅長時間分辨X射線晶體學。
“你可以說我們正在將結構生物學帶入蛋白質動力學的新時代，在這個時代，有必要結合我們的各種方法來理解和量化所有細節(jié)。一種方法為另一種方法提供了有價值的信息，通過組合和整合這些方法，我們可以共同為創(chuàng)造關于蛋白質和較小分子如何相互作用的全新知識做出貢獻，“KrestenLindorff-Larsen說。
根據(jù)研究人員的說法，結果可以與描述分子和蛋白質如何相互結合的高級分子薄膜進行比較。研究人員希望獲得新的見解，了解藥物分子與體內蛋白質結合需要多長時間以及分子在那里停留多長時間。從長遠來看，這些知識可能會導致獨特設計和更有效的藥物。
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