由 UT 西南醫(yī)學(xué)中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個團隊開發(fā)了深度學(xué)習(xí)模型，以確定一組簡單的規(guī)則來控制啟動子的活動，啟動子是啟動基因產(chǎn)生蛋白質(zhì)過程的 DNA 區(qū)域。
他們的研究結(jié)果發(fā)表在《科學(xué)》雜志上，可以使人們更好地理解啟動子如何促進基因調(diào)控。健康和疾病的
“雖然啟動子對于每個基因的功能都是必不可少的，但我們對這些遺傳元件如何發(fā)揮作用的理解如何運作的理解并不完整，盡管數(shù)十年的研究已經(jīng)定義了它們的許多特征。我們的研究為這些序列如何在人類和其他哺乳動物中發(fā)揮作用提供了新的線索， ” UT 西南大學(xué) Lyda Hill 生物信息學(xué)系助理教授周健博士說。
周博士與第一作者、周實驗室研究生 Kseniia Dudnyk 和德克薩斯大學(xué)西南兒童醫(yī)學(xué)中心研究所前研究員 Ken Xu 博士共同領(lǐng)導(dǎo)了這項研究。
細胞用來執(zhí)行其活動的蛋白質(zhì)的產(chǎn)生始于一個稱為轉(zhuǎn)錄的過程。此時，RNA 聚合酶蛋白會附著在 DNA 鏈上，并將編碼信息復(fù)制(或轉(zhuǎn)錄)到 RNA 分子中。 RNA 聚合酶附著并開始轉(zhuǎn)錄的區(qū)域稱為啟動子。
在人類中，啟動子通常由數(shù)百個堿基對(構(gòu)成 DNA 的單位)組成。盡管研究人員已經(jīng)確定了一些 DNA 啟動子區(qū)域共享的共同堿基對序列，但這些序列在人類啟動子中通常不存在，使得 DNA 序列如何指導(dǎo)轉(zhuǎn)錄過程的規(guī)則尚不清楚。
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