蛋白質組學是對蛋白質的研究和分析,包括它們在生物系統(tǒng)中的結構、功能、相互作用和修飾。人類有大約 20,000 個基因,這些基因產生超過一百萬種不同的蛋白質變體,包括估計的 100,000 種蛋白質同種型。這些蛋白質變體構成了蛋白質組的巨大復雜性,而這些蛋白質組在很大程度上仍未被探索。
越來越多的文獻表明蛋白質異構體具有很高的生物醫(yī)學重要性,因為來自同一基因的蛋白質異構體可以具有不同的生物學功能,并在細胞過程中發(fā)揮不同的作用。在整個人群的蛋白質變異水平上對蛋白質組的研究可以讓我們了解生物學,并為我們如何識別和治療疾病以及管理健康提供未來的科學進步。
在 3 月 29 日發(fā)表在PLoS One雜志上的一項研究中,Seer 科學家與紀念斯隆凱特琳癌癥中心的醫(yī)學博士 Luis Diaz 合作,發(fā)現(xiàn)了四種結構不同的蛋白質亞型,它們在非小細胞肺癌(NSCLC) 患者中差異表達。通過使用深度、無偏見的蛋白質組學方法在肽水平分辨率下比較癌癥患者與健康受試者的蛋白質組學特征,可以鑒定在 NSCLC 中差異表達的蛋白質亞型。
“這些發(fā)現(xiàn)表明,不同的蛋白質亞型可能對不同的生物學機制和癌癥的發(fā)病機制有不同的貢獻,可能為識別新的診斷標志物或新的治療靶點鋪平道路,”實體腫瘤腫瘤學部主任 Diaz 博士說。在紀念斯隆凱特琳癌癥中心。“這里特別令人鼓舞的是,這些蛋白質亞型是在血漿中檢測到的,血漿是一種易于獲取的樣本類型,能夠通過對患者進行液體活檢評估來檢測和監(jiān)測癌癥。”
該研究分析了來自 NSCLC 患者和健康對照者的 188 種血漿蛋白質組,以確定與疾病相關的蛋白質亞型。這些蛋白質變體在身體的生物通路中發(fā)揮著不同的作用,并且可以影響疾病的易感性和進展。Seer 的深度、公正的蛋白質組學平臺揭示了多種蛋白質同種型,其中一些與健康對照相比在 NSCLC 中表現(xiàn)出顯著不同的行為,包括骨形態(tài)發(fā)生蛋白 1 (BMP1)、補體成分 4a (C4a)、補體成分 1r (C1r) 和乳酸脫氫酶 B (LDHB)。
BMP1 蛋白的一種關鍵亞型以前從未與 NSCLC 相關聯(lián)。研究人員發(fā)現(xiàn),健康人的標準長蛋白水平較高,而 NSCLC 患者的縮短蛋白亞型水平較高,這種蛋白缺乏釋放膠原蛋白的能力,這可能會影響腫瘤微環(huán)境。研究結果表明 BMP1 可能在 NSCLC 疾病的發(fā)病機制中發(fā)揮作用。
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