確定可以預(yù)測(cè)某些類型乳腺癌的新遺傳特征

研究人員已經(jīng)確定了一些具有乳腺癌預(yù)后價(jià)值的遺傳特征。這一發(fā)現(xiàn)也有助于更好地理解癌癥等疾病期間病理性血管生成、血管異常增生的分子機(jī)制。

這項(xiàng)發(fā)表在《PLOS Genetics》雜志上的研究結(jié)合了視網(wǎng)膜病變相關(guān)基因(作為血管生成模型)的研究，并分析了來(lái)自公共乳腺癌數(shù)據(jù)庫(kù)的轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)譜。

這項(xiàng)研究是由圣保羅大學(xué)化學(xué)研究所的研究人員與加拿大多倫多安大略癌癥研究所(OICR)合作進(jìn)行的，并得到了圣保羅研究基金會(huì)-FAPESP的支持。

“我們已經(jīng)確定了一組基因，其在乳腺癌中的表達(dá)與腫瘤中病理性血管生成的程度有關(guān)。因此，鑒于先前發(fā)現(xiàn)的相關(guān)性，它可以用作血管生成的遺傳標(biāo)記，這比先前鑒定的標(biāo)記更具預(yù)后性和更強(qiáng)有力。血管生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人、該研究的合著者、IQ-USP教授Ricardo Giordano說(shuō)。

在這項(xiàng)研究中，巴西研究人員在健康和患病的小鼠視網(wǎng)膜中發(fā)現(xiàn)了153個(gè)改變的基因。他們從這個(gè)列表中鑒定出149個(gè)相同的人類基因。這些結(jié)果是與加拿大團(tuán)隊(duì)合作進(jìn)行的基因特征研究的基礎(chǔ)，該團(tuán)隊(duì)使用了一個(gè)包含乳腺癌患者信息的數(shù)據(jù)庫(kù)。結(jié)論：就病理預(yù)后而言，參與病理性血管生成的11個(gè)關(guān)鍵基因是最好的。

病理性血管生成常見(jiàn)于乳腺癌和視網(wǎng)膜病變。USP生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人Jo oCarlos Setubal說(shuō)：“這兩種疾病共享這一過(guò)程，血管生成是癌癥發(fā)展的基礎(chǔ)這一事實(shí)促使我們?cè)噲D在視網(wǎng)膜病變和乳腺癌之間架起一座橋梁?！蔽恼碌暮现?。

據(jù)研究人員稱，這項(xiàng)研究主要針對(duì)乳腺癌，因?yàn)橛写罅筷P(guān)于這種疾病的可用數(shù)據(jù)。Setubal說(shuō)：“鑒于一個(gè)患者和另一個(gè)患者之間的巨大差異，我們必須訪問(wèn)大量公共數(shù)據(jù)。乳腺癌就是這種情況?；驁D譜可以用于大約2000名患者，”setubal說(shuō)。

他補(bǔ)充說(shuō)，生物信息學(xué)對(duì)于發(fā)現(xiàn)遺傳特征至關(guān)重要。與加拿大OICR的研究人員合作，將實(shí)驗(yàn)室產(chǎn)生的數(shù)據(jù)提交給復(fù)雜的計(jì)算和處理。這項(xiàng)研究的另一位合著者、當(dāng)時(shí)還是博士生的羅德里戈瓜里斯奇德索薩(Rodrigo Guarischi de Sousa)編寫了這個(gè)程序，并測(cè)試了149個(gè)人類基因，這些基因可能是乳腺癌特征的一部分。在這部分研究中，他得到了FAPESP獎(jiǎng)學(xué)金的支持，這是一個(gè)由OICR的保羅布特羅斯指導(dǎo)的國(guó)外研究實(shí)習(xí)項(xiàng)目。

布特羅斯目前是加州大學(xué)洛杉磯分校人類遺傳學(xué)系的研究員。瓜里斯奇德索薩現(xiàn)在在巴西最大的醫(yī)療診斷公司DASA工作。

研究人員計(jì)劃找到這一特征的應(yīng)用，尤其是在乳腺癌的治療中。喬治達(dá)諾說(shuō)：“我們的下一個(gè)目標(biāo)是繼續(xù)研究癌癥中的血管生成。”“我們有興趣確定這份清單中的基因，這些基因可以作為開發(fā)新藥或現(xiàn)有藥物的新應(yīng)用靶點(diǎn)?！?

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