哥倫比亞大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)研究所(DSI)的兩名畢業(yè)生正在使用計(jì)算設(shè)計(jì)來(lái)快速發(fā)現(xiàn)的治療方法。
安德魯薩茨和布雷特艾弗索分別是EVQLV的首席執(zhí)行官和首席技術(shù)官。EVQLV是一家初創(chuàng)公司，其算法可以計(jì)算、生成、篩選和優(yōu)化數(shù)億個(gè)治療性抗體。他們利用自己的技術(shù)找到了最有可能幫助那些感染新冠病毒的人的治療方法。機(jī)器學(xué)習(xí)算法可以快速篩選治療性抗體，成功率高。
在實(shí)驗(yàn)室里找到抗體通常需要幾年的時(shí)間。該算法只需要一周的時(shí)間就能識(shí)別出能夠抵抗這種病毒的抗體。薩茨說(shuō)，加快開發(fā)能夠幫助感染者的治療方法非常重要。2018年為DSI校友，2015年畢業(yè)于哥倫比亞大學(xué)普通教育學(xué)院。
我們正在減少識(shí)別有希望的抗體候選物的時(shí)間。研究表明，在實(shí)驗(yàn)室平均需要五年半的時(shí)間來(lái)發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化抗體。我們的算法可以大大減少時(shí)間和成本。"
加速這一過程的第一階段——抗體發(fā)現(xiàn)——對(duì)于加速新冠療法的發(fā)現(xiàn)還有很長(zhǎng)的路要走。在EVQLV執(zhí)行計(jì)算抗體發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化后，它將有希望的抗體基因序列發(fā)送給其實(shí)驗(yàn)室合作伙伴。然后，實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員設(shè)計(jì)和測(cè)試抗體，這需要幾個(gè)月而不是幾年。被發(fā)現(xiàn)成功的抗體將用于動(dòng)物研究，最終用于人類研究。
考慮到國(guó)際社會(huì)抗擊的緊迫性，薩茨表示，有可能在2020年底前為患者制定治療計(jì)劃。
他補(bǔ)充道：“我們的算法要做的是降低實(shí)驗(yàn)室藥物發(fā)現(xiàn)失敗的可能性?！薄拔覀儽M量讓電腦出現(xiàn)故障，以減少實(shí)驗(yàn)室下游出現(xiàn)故障的可能性。這樣可以從耗時(shí)費(fèi)力的工作中節(jié)省大量時(shí)間?！?
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