奧地利第一批21個(gè)新型基因組現(xiàn)已完成，并在奧地利科學(xué)院分子醫(yī)學(xué)研究中心CeMM最近與維也納醫(yī)科大學(xué)密切合作發(fā)起的“新型突變動(dòng)力學(xué)”項(xiàng)目范圍內(nèi)發(fā)布。該項(xiàng)目的目的是對(duì)從奧地利患者樣本中獲得的1000個(gè)病毒基因組進(jìn)行測(cè)序，以了解更多關(guān)于新冠和致病細(xì)菌的分子理解。這個(gè)項(xiàng)目的結(jié)果將把奧地利病毒的基因組數(shù)據(jù)整合到新型突變的全球地圖中，這將有助于破譯新冠背后的突變動(dòng)力學(xué)。
2020年3月12日，由新型引起的新冠被世界衛(wèi)生組織(WHO)宣布為。據(jù)信，該病已從野生動(dòng)物傳播到人類，并于2019年11月在中國(guó)湖北省傳播。超過(guò)180個(gè)國(guó)家受到影響，新冠病已經(jīng)造成數(shù)千人死亡。
為了了解病毒在人類中的進(jìn)化，國(guó)際研究界已經(jīng)開始公開提供循環(huán)新型病毒的基因組序列。到目前為止，奧地利分離毒株的病毒基因組還沒(méi)有報(bào)道，這是全球傳播途徑和病毒進(jìn)化對(duì)比分析的一大空白。為了克服這個(gè)問(wèn)題，CeMM首席研究員Andreas Bergthaler和Christoph Bock發(fā)起了一個(gè)合作項(xiàng)目，旨在通過(guò)使用先進(jìn)的下一代測(cè)序技術(shù)和復(fù)雜的計(jì)算分析方法來(lái)闡明奧地利患者的新型基因組。
我們與維也納醫(yī)科大學(xué)病毒學(xué)中心合作，開發(fā)了一種快速反應(yīng)策略，以一種省時(shí)有效的方式從患者體內(nèi)產(chǎn)生新型基因組序列。這解決了與國(guó)家公共衛(wèi)生和醫(yī)學(xué)研究相關(guān)的問(wèn)題，例如跟蹤新型引起的急性呼吸道疾病不同階段的感染鏈或時(shí)間分辨病毒分析。"
CeMM項(xiàng)目負(fù)責(zé)人兼首席研究員
對(duì)來(lái)自?shī)W地利的29，900個(gè)核苷酸的新型基因組的初步序列分析表明，在中國(guó)湖北省省會(huì)武漢，平均有6個(gè)突變與2019年12月分離的參考基因組不同。觀察到的突變數(shù)量與最近報(bào)道的其他新型基因組一致。大多數(shù)觀察到的突變都會(huì)導(dǎo)致病毒蛋白的變化，這為正向選擇壓力和人類群體進(jìn)化提供了證據(jù)。評(píng)估這些突變對(duì)病毒生命周期的實(shí)際影響以及它們與宿主和免疫系統(tǒng)的相互作用將在未來(lái)的研究范圍內(nèi)。正在進(jìn)行的深入基因組分析聚焦于突變熱點(diǎn)，
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