奧地利第一批21個新型基因組現(xiàn)已完成，并在奧地利科學(xué)院分子醫(yī)學(xué)研究中心CeMM最近與維也納醫(yī)科大學(xué)密切合作發(fā)起的“新型突變動力學(xué)”項(xiàng)目范圍內(nèi)發(fā)布。該項(xiàng)目的目的是對從奧地利患者樣本中獲得的1000個病毒基因組進(jìn)行測序，以了解更多關(guān)于新冠和致病細(xì)菌的分子理解。這個項(xiàng)目的結(jié)果將把奧地利病毒的基因組數(shù)據(jù)整合到新型突變的全球地圖中，這將有助于破譯新冠背后的突變動力學(xué)。
2020年3月12日，由新型引起的新冠被世界衛(wèi)生組織(WHO)宣布為。據(jù)信，該病已從野生動物傳播到人類，并于2019年11月在中國湖北省傳播。超過180個國家受到影響，新冠病已經(jīng)造成數(shù)千人死亡。
為了了解病毒在人類中的進(jìn)化，國際研究界已經(jīng)開始公開提供循環(huán)新型病毒的基因組序列。到目前為止，奧地利分離毒株的病毒基因組還沒有報道，這是全球傳播途徑和病毒進(jìn)化對比分析的一大空白。為了克服這個問題，CeMM首席研究員Andreas Bergthaler和Christoph Bock發(fā)起了一個合作項(xiàng)目，旨在通過使用先進(jìn)的下一代測序技術(shù)和復(fù)雜的計算分析方法來闡明奧地利患者的新型基因組。
我們與維也納醫(yī)科大學(xué)病毒學(xué)中心合作，開發(fā)了一種快速反應(yīng)策略，以一種省時有效的方式從患者體內(nèi)產(chǎn)生新型基因組序列。這解決了與國家公共衛(wèi)生和醫(yī)學(xué)研究相關(guān)的問題，例如跟蹤新型引起的急性呼吸道疾病不同階段的感染鏈或時間分辨病毒分析。"
CeMM項(xiàng)目負(fù)責(zé)人兼首席研究員
對來自奧地利的29，900個核苷酸的新型基因組的初步序列分析表明，在中國湖北省省會武漢，平均有6個突變與2019年12月分離的參考基因組不同。觀察到的突變數(shù)量與最近報道的其他新型基因組一致。大多數(shù)觀察到的突變都會導(dǎo)致病毒蛋白的變化，這為正向選擇壓力和人類群體進(jìn)化提供了證據(jù)。評估這些突變對病毒生命周期的實(shí)際影響以及它們與宿主和免疫系統(tǒng)的相互作用將在未來的研究范圍內(nèi)。正在進(jìn)行的深入基因組分析聚焦于突變熱點(diǎn)，
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