由加州大學(xué)圣地亞哥分校的科學(xué)家和加州大學(xué)圣地亞哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)拓寬并加深了對(duì)遺傳性視網(wǎng)膜營(yíng)養(yǎng)不良 (IRD) 如何影響不同人群的理解，并在此過程中，確定了可能導(dǎo)致疾病的新基因變異。
該研究結(jié)果發(fā)表在 2021 年 10 月 18 日的PLOS Genetics 上。
IRD 是一組疾病，從色素性視網(wǎng)膜炎到無脈絡(luò)膜血癥，會(huì)導(dǎo)致進(jìn)行性視力喪失，甚至失明。每個(gè) IRD 至少由一個(gè)基因突變引起，盡管同一基因的突變可能導(dǎo)致不同的 IRD 診斷。
IRD 很少見，但它們影響所有年齡段的人，以不同的速度發(fā)展，即使在患有相同疾病的家庭中也是如此。具體診斷取決于發(fā)現(xiàn)遺傳致病突變。
美國(guó)食品和藥物管理局已批準(zhǔn)基因療法來治療一種涉及 RPE65 基因的 IRD，但對(duì)于由 280 多個(gè)不同基因突變引起的其他 IRD，尚無治愈方法或治療方法被證明可以減緩疾病進(jìn)展。
研究人員對(duì)來自 108 個(gè)不相關(guān)家族譜系的 409 人進(jìn)行了全基因組序列 (WGS)，每個(gè)人都有先前診斷出的 IRD。WGS 是確定個(gè)體 DNA 序列的全部或接近全部的過程。它提供了一個(gè)人的整個(gè)基因組的全面畫像，包括突變和變異，可用于廣泛的比較目的。
研究參與者來自三個(gè)不同的地理區(qū)域：墨西哥、巴基斯坦和居住在美國(guó)的歐洲裔美國(guó)人。從所有參與者的血液樣本中進(jìn)行基因組分析，揭示了 108 個(gè)譜系中 62 個(gè)譜系的致病變異。在 62 個(gè)家族中總共發(fā)現(xiàn)了 94 個(gè)基因變異：52 個(gè)變異以前被確定為致病基因，42 個(gè)沒有。令人驚訝的是，超過一半的新變體沒有被列入基因組聚合數(shù)據(jù)庫(kù)，這是一個(gè)國(guó)際基因組數(shù)據(jù)匯編。
總體而言，在 63% 的墨西哥參與者、60% 的巴基斯坦參與者和 48% 的歐洲美國(guó)人中檢測(cè)到了致病變異。
該研究還確定了大量特定于研究人群的新 IRD 致病突變，并揭示了導(dǎo)致遺傳性視網(wǎng)膜營(yíng)養(yǎng)不良的突變類型。大約 13% 的家族在基因組中表現(xiàn)出非典型或意外的變化。五個(gè)家族譜系在所有受影響的個(gè)體中都發(fā)生了不止一種基因的突變;一個(gè)家庭在不同的基因在不同的受影響的成員進(jìn)行突變和從頭突變是在一個(gè)病人時(shí)不存在于雙方父母發(fā)現(xiàn)。
另有 8% 的家族基因組結(jié)構(gòu)發(fā)生較大變化，導(dǎo)致遺傳性視網(wǎng)膜疾病，四個(gè)家族的初步臨床診斷根據(jù)其基因型重新分類。
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