國(guó)家兒童醫(yī)院的專家開(kāi)發(fā)了一種新方法，在單個(gè)腫瘤細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了獨(dú)特的蛋白質(zhì)，然后幫助科學(xué)家生成個(gè)性化T細(xì)胞來(lái)靶向和殺死腫瘤，根據(jù)一項(xiàng)臨床前研究(“新抗原的蛋白質(zhì)基因組發(fā)現(xiàn)有助于個(gè)性化多抗原靶向T細(xì)胞”)腦腫瘤的細(xì)胞免疫療法”)發(fā)表在《自然通訊》上。
據(jù)報(bào)道，這項(xiàng)工作首次創(chuàng)建了新抗原識(shí)別的新工作流程，該工作流程結(jié)合了基因測(cè)序和蛋白質(zhì)識(shí)別，為兒童髓母細(xì)胞瘤(一種常見(jiàn)的惡性腦腫瘤)提供個(gè)性化治療。鑒于這些發(fā)現(xiàn)，研究人員現(xiàn)在正在設(shè)計(jì)一項(xiàng)I期臨床試驗(yàn)，預(yù)計(jì)在12-18個(gè)月內(nèi)啟動(dòng)。
“兒科腦腫瘤中新抗原的發(fā)現(xiàn)因其低突變負(fù)荷和組織可用性不足而受到阻礙。在這里，我們開(kāi)發(fā)了一種蛋白質(zhì)組學(xué)方法，將腫瘤DNA/RNA測(cè)序和質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)相結(jié)合，以識(shí)別由多種基因組畸變產(chǎn)生的腫瘤限制性(新抗原)肽，從而產(chǎn)生高度靶標(biāo)特異性、自體、個(gè)性化的T細(xì)胞免疫療法，”研究人員寫道。
“我們的數(shù)據(jù)表明，異常剪接點(diǎn)是髓母細(xì)胞瘤(一種常見(jiàn)的兒科腦腫瘤)中新抗原的主要來(lái)源。蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定的腫瘤特異性肽具有免疫原性，并產(chǎn)生基于MHCII的T細(xì)胞反應(yīng)。此外，針對(duì)腫瘤特異性肽的多克隆和多功能T細(xì)胞可以在體外有效消除腫瘤細(xì)胞。靶向腫瘤特異性抗原可以避免中樞免疫耐受的問(wèn)題，同時(shí)可能提供有利于與其他免疫激活療法組合的安全裕度。
“這些發(fā)現(xiàn)證明了免疫原性腫瘤特異性肽的蛋白質(zhì)基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)，并為腦腫瘤兒童的個(gè)性化靶向T細(xì)胞療法奠定了基礎(chǔ)。”
“這項(xiàng)工作是個(gè)性化醫(yī)療領(lǐng)域令人難以置信的令人興奮的進(jìn)步。它將使我們能夠用針對(duì)每位患者開(kāi)發(fā)的新型T細(xì)胞療法來(lái)治療患者，以專門攻擊和殺死他們的腫瘤。”該論文的資深作者。“這種治療將為患有難以治療的腦腫瘤的兒童提供一個(gè)潛在的選擇，因?yàn)樗衅渌委煼椒ǘ家延帽M。”
首先，研究人員對(duì)小組織樣本的DNA進(jìn)行了測(cè)序，同時(shí)研究了影響癌癥生物學(xué)的全套蛋白質(zhì)——作者也將其稱為“低輸入蛋白質(zhì)組學(xué)方法”。在分析了避開(kāi)常用預(yù)測(cè)模型的經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù)后，研究人員開(kāi)發(fā)了一種T細(xì)胞免疫療法，該療法針對(duì)腫瘤的獨(dú)特蛋白質(zhì)，并使T細(xì)胞能夠區(qū)分健康細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞。
這意味著Rivero-Hinojosa等人。成功地合并了蛋白質(zhì)基因組學(xué)和免疫治療這兩個(gè)研究領(lǐng)域，并為治療患有腦腫瘤的兒童的個(gè)性化、靶向T細(xì)胞療法奠定了基礎(chǔ)。
“新抗原發(fā)現(xiàn)技術(shù)要么依賴于計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)算法，要么需要大量腫瘤組織，這使得它們不適合大多數(shù)腦腫瘤，”神經(jīng)腫瘤學(xué)和腦腫瘤研究所醫(yī)學(xué)主任BrianRood醫(yī)學(xué)博士指出。兒童國(guó)家.“這個(gè)新抗原識(shí)別管道為擴(kuò)展基于T細(xì)胞的免疫療法創(chuàng)造了新的機(jī)會(huì)。”
“我們開(kāi)發(fā)了一種新的過(guò)濾管道來(lái)去除未注釋的正常肽。靶向腫瘤完全特異性且在體內(nèi)其他地方不表達(dá)的抗原，將有可能增加腫瘤抗原特異性T細(xì)胞產(chǎn)物的強(qiáng)度，同時(shí)降低毒性，”國(guó)家兒童醫(yī)院的科學(xué)家SamuelRivero-Hinojosa博士補(bǔ)充道。和該研究的第一作者。
一旦專家們鑒定出這些獨(dú)特的肽，他們就用它們來(lái)選擇和擴(kuò)增T細(xì)胞，這些T細(xì)胞表現(xiàn)出對(duì)腫瘤特異性新抗原的特異性和殺死腫瘤細(xì)胞的能力。下一步是進(jìn)行臨床試驗(yàn)，訓(xùn)練患者自身的T細(xì)胞識(shí)別腫瘤獨(dú)特的新抗原，然后將其回輸回患者體內(nèi)。
從免疫治療的角度來(lái)看，腫瘤特異性很重要，因?yàn)楫?dāng)臨床醫(yī)生用T細(xì)胞療法治療患者時(shí)，他們希望確保T細(xì)胞直接靶向并殺死腫瘤，并且不會(huì)對(duì)健康細(xì)胞造成毀滅性傷害。本文證明，利用這種新技術(shù)也許可以創(chuàng)造更好的功效和安全裕度。
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