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兩項(xiàng)新研究強(qiáng)調(diào)了在分析人類腸道微生物組時(shí)觀察細(xì)菌菌株的重要性

導(dǎo)讀 加利福尼亞州舊金山 — 2021 年 12 月 23 日 — 每天,您消化系統(tǒng)中的數(shù)十億細(xì)菌都在發(fā)生變化;你吃的食物、你服用的藥物和你接觸

加利福尼亞州舊金山 — 2021 年 12 月 23 日 — 每天,您消化系統(tǒng)中的數(shù)十億細(xì)菌都在發(fā)生變化;你吃的食物、你服用的藥物和你接觸的細(xì)菌會(huì)使某些細(xì)菌比其他細(xì)菌繁殖得更多??茖W(xué)家們知道,這種不斷變化的腸道微生物平衡與您的健康和疾病有關(guān),但一直在努力確定是什么使一種微生物平衡優(yōu)于另一種。

在過(guò)去的十年里,科學(xué)家們通常通過(guò)描述存在的細(xì)菌種類和數(shù)量來(lái)描述一個(gè)人的微生物組——在人類腸道中發(fā)現(xiàn)的微生物的集合?,F(xiàn)在,由凱蒂·波拉德(Katie Pollard) 博士領(lǐng)導(dǎo)的一組研究人員在格萊斯頓研究所發(fā)表了兩項(xiàng)新研究,表明監(jiān)測(cè)細(xì)菌菌株——而不僅僅是物種——可以更好地了解微生物組。

細(xì)菌菌株有點(diǎn)像狗品種或番茄品種——屬于同一物種,但彼此不同。

“我認(rèn)為研究人員僅僅關(guān)注微生物的種類就錯(cuò)過(guò)了很多信息,”格萊斯頓數(shù)據(jù)科學(xué)與生物技術(shù)研究所所長(zhǎng)、兩項(xiàng)研究的主要作者波拉德說(shuō)。“當(dāng)我們采取更細(xì)粒度的方法并觀察細(xì)菌菌株時(shí),我預(yù)測(cè)我們將開(kāi)始尋找微生物組與疾病之間的因果關(guān)系。”

在Nature Biotechnology雜志上發(fā)表的一項(xiàng)研究中,Pollard 的實(shí)驗(yàn)室與美國(guó)能源部聯(lián)合基因組研究所的研究科學(xué)家Stephen Nayfach 博士合作,開(kāi)發(fā)了一種新的計(jì)算方法來(lái)分析微生物組樣本中存在的細(xì)菌菌株。比現(xiàn)有技術(shù)更快、更經(jīng)濟(jì)。Pollard 說(shuō),這種新方法將使研究人員能夠?qū)ξ⑸锝M進(jìn)行比以往任何時(shí)候都更大、更精確的分析。

在Genome Research在線發(fā)表的另一篇論文中,Pollard 與斯坦福大學(xué)的Benjamin Good 博士和Michael Snyder 博士的實(shí)驗(yàn)室合作,在 5 到 19 個(gè)不同的時(shí)間點(diǎn)跟蹤一個(gè)人微生物組中存在的細(xì)菌菌株。一個(gè)月期間,包括一個(gè)療程的抗生素之前和之后。他們發(fā)現(xiàn),在某些情況下,一種細(xì)菌的豐度在不同時(shí)間點(diǎn)之間保持不變,但該物種內(nèi)的菌株發(fā)生了巨大變化。

讓微生物組有意義

在您的腸道內(nèi),細(xì)菌可能不僅僅是消化您的食物。事實(shí)上,研究表明,與健康人相比,患有炎癥性腸病、哮喘、自閉癥、糖尿病和癌癥等多種疾病的人消化系統(tǒng)中的細(xì)菌不同。但到目前為止,很少有針對(duì)微生物組的治療方法從這些觀察中得出。

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