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Sci-space可以幫助構(gòu)建哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育圖譜

導(dǎo)讀 一種稱(chēng)為 sci-Space 的新技術(shù)與來(lái)自其他技術(shù)的數(shù)據(jù)相結(jié)合,可以在哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育過(guò)程中生成跨不同細(xì)胞的基因表達(dá)的四維圖譜。這樣的圖

一種稱(chēng)為 sci-Space 的新技術(shù)與來(lái)自其他技術(shù)的數(shù)據(jù)相結(jié)合,可以在哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育過(guò)程中生成跨不同細(xì)胞的基因表達(dá)的四維圖譜。

這樣的圖譜將繪制單個(gè)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄如何反映時(shí)間的流逝、細(xì)胞譜系、細(xì)胞遷移和發(fā)育中胚胎的位置。它們還將有助于闡明基因表達(dá)的空間調(diào)節(jié)。

哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育是一個(gè)非凡的現(xiàn)象:受精卵反復(fù)分裂并在幾周或幾個(gè)月內(nèi)變成一個(gè)復(fù)雜的有機(jī)體,能夠進(jìn)行無(wú)數(shù)的生理過(guò)程并由各種細(xì)胞、組織、器官、解剖結(jié)構(gòu)組成。

更好地了解哺乳動(dòng)物在出生前是如何形成的——尤其是胚胎發(fā)育過(guò)程中單細(xì)胞水平基因表達(dá)的產(chǎn)前空間模式——可以促進(jìn)對(duì)各種條件的生物醫(yī)學(xué)和獸醫(yī)研究。這些范圍從遺傳性疾病到先天性畸形和發(fā)育遲緩。了解器官的起源也可能有助于未來(lái)的再生醫(yī)學(xué)工作。

由 UW Medicine、Howard Hughes 醫(yī)學(xué)研究所和西雅圖 Brotman Baty 精密醫(yī)學(xué)研究所的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際團(tuán)隊(duì)展示了他們?cè)谛∈笈咛ブ械?sci-Space 技術(shù)的概念驗(yàn)證。

他們的結(jié)果發(fā)表在 7 月 2 日的《科學(xué)》雜志上。主要作者是華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院基因組科學(xué)系的 Sanjay R. Srivatsan 和華盛頓大學(xué)生物工程系的 Mary C. Regier。

資深作者是華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)基因組科學(xué)教授、布羅特曼巴蒂研究所所長(zhǎng)杰伊·申杜爾,以及艾倫細(xì)胞譜系追蹤發(fā)現(xiàn)中心的研究員;華盛頓大學(xué)生物工程助理教授 Kelly R. Stevens;和基因組科學(xué)副教授 Cole Trapnell。Regier 和 Stevens 還是 UW 醫(yī)學(xué)研究所干細(xì)胞和再生醫(yī)學(xué)研究所的研究員。

研究人員觀察了 120,000 個(gè)細(xì)胞核中基因的編排。身體的所有體細(xì)胞都包含相同的 DNA 代碼。當(dāng)小鼠胚胎成形時(shí),研究人員捕獲了有關(guān)這些細(xì)胞核中哪些基因被打開(kāi)或關(guān)閉的信息。科學(xué)家們還研究了胚胎中細(xì)胞的位置如何影響發(fā)育過(guò)程中哪些基因被激活。

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