來自 Sinai Health 的研究人員發(fā)表了一項研究，該研究提供了對活體人體細胞組織的超詳細研究，提供了一種新工具，可以幫助世界各地的科學(xué)家更好地了解疾病期間發(fā)生的情況。
今天發(fā)表在《自然》雜志上的這項新研究是在 Anne-Claude Gingras 博士的實驗室進行的，他是 Lunenfeld-Tanenbaum 研究所 (LTRI) 的高級研究員，也是多倫多大學(xué)分子遺傳學(xué)系的教授.
共同第一作者 Christopher Go 和 James Knight 博士使用 192 個已知存在于特定細胞器中的蛋白質(zhì)的標記調(diào)查了人類細胞景觀，這些蛋白質(zhì)可以“標記”同一隔室中的相鄰蛋白質(zhì)。
“人類細胞圖譜能夠預(yù)測 4,000 種蛋白質(zhì)在活體人體細胞所有隔室中的定位，”Go 說。“我們對人體細胞的所有主要細胞器進行了采樣，并使用創(chuàng)新分析創(chuàng)建了迄今為止最高分辨率的圖譜，在預(yù)測許多未映射蛋白質(zhì)的新定位方面具有很高的準確性。”
人體由數(shù)以萬億計的細胞組成，每個細胞都進一步分為具有特定功能的不同隔間，就像房子有不同的房間用于睡覺或準備食物一樣。這些稱為細胞器的隔室包含不同的蛋白質(zhì)，執(zhí)行與隔室相關(guān)的特定活動。線粒體，即所謂的細胞動力源，是細胞器的一個例子。
科學(xué)家們說，了解哪些蛋白質(zhì)駐留在哪些細胞器中是了解每種細胞蛋白質(zhì)作用的重要第一步。早期的方法通常使用先殺死細胞，然后再嘗試將細胞器彼此分離的方法。
“以前，這就像把房子拆開來隔離每個單獨的房間，”Go 說。“這些方法往往只提供細胞組織的粗略觀點。”
Gingras 實驗室開發(fā)了使用稱為質(zhì)譜儀的儀器檢測蛋白質(zhì)的工具。在這項新研究中，他們純化了被細胞器標記“標記”的蛋白質(zhì)，并通過質(zhì)譜法鑒定了它們中的每一個。然后，該團隊使用計算工具來重建人體細胞。
LTRI Gingras 實驗室的生物信息學(xué)家 Knight 博士說：“通過我們的研究，我們已經(jīng)表明，我們可以以相對較少的努力一次精確定位數(shù)千種蛋白質(zhì)。”“以前定位蛋白質(zhì)的方法需要單獨研究每種蛋白質(zhì)，或者需要有限的關(guān)注。”
鑒于人類細胞圖譜的廣泛性，該團隊還創(chuàng)建了一個分析門戶，讓世界各地的研究人員能夠更深入地研究數(shù)據(jù)。用戶可以詳細掃描 192 個標記中的每一個，并將他們自己的蛋白質(zhì)定位數(shù)據(jù)與人類細胞圖譜中的預(yù)測進行比較。
標簽： SinaiHealth
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