Sinai Health科學家提供詳細地圖以了解人體細胞

來自 Sinai Health 的研究人員發(fā)表了一項研究，該研究提供了對活體人體細胞組織的超詳細研究，提供了一種新工具，可以幫助世界各地的科學家更好地了解疾病期間發(fā)生的情況。

今天發(fā)表在《自然》雜志上的這項新研究是在 Anne-Claude Gingras 博士的實驗室進行的，他是 Lunenfeld-Tanenbaum 研究所 (LTRI) 的高級研究員，也是多倫多大學分子遺傳學系的教授.

共同第一作者 Christopher Go 和 James Knight 博士使用 192 個已知存在于特定細胞器中的蛋白質的標記調查了人類細胞景觀，這些蛋白質可以“標記”同一隔室中的相鄰蛋白質。

“人類細胞圖譜能夠預測 4,000 種蛋白質在活體人體細胞所有隔室中的定位，”Go 說。“我們對人體細胞的所有主要細胞器進行了采樣，并使用創(chuàng)新分析創(chuàng)建了迄今為止最高分辨率的圖譜，在預測許多未映射蛋白質的新定位方面具有很高的準確性。”

人體由數(shù)以萬億計的細胞組成，每個細胞都進一步分為具有特定功能的不同隔間，就像房子有不同的房間用于睡覺或準備食物一樣。這些稱為細胞器的隔室包含不同的蛋白質，執(zhí)行與隔室相關的特定活動。線粒體，即所謂的細胞動力源，是細胞器的一個例子。

科學家們說，了解哪些蛋白質駐留在哪些細胞器中是了解每種細胞蛋白質作用的重要第一步。早期的方法通常使用先殺死細胞，然后再嘗試將細胞器彼此分離的方法。

“以前，這就像把房子拆開來隔離每個單獨的房間，”Go 說。“這些方法往往只提供細胞組織的粗略觀點。”

Gingras 實驗室開發(fā)了使用稱為質譜儀的儀器檢測蛋白質的工具。在這項新研究中，他們純化了被細胞器標記“標記”的蛋白質，并通過質譜法鑒定了它們中的每一個。然后，該團隊使用計算工具來重建人體細胞。

LTRI Gingras 實驗室的生物信息學家 Knight 博士說：“通過我們的研究，我們已經(jīng)表明，我們可以以相對較少的努力一次精確定位數(shù)千種蛋白質。”“以前定位蛋白質的方法需要單獨研究每種蛋白質，或者需要有限的關注。”

鑒于人類細胞圖譜的廣泛性，該團隊還創(chuàng)建了一個分析門戶，讓世界各地的研究人員能夠更深入地研究數(shù)據(jù)。用戶可以詳細掃描 192 個標記中的每一個，并將他們自己的蛋白質定位數(shù)據(jù)與人類細胞圖譜中的預測進行比較。

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