古代腸道菌群可能為現(xiàn)代疾病提供線索

波士頓-(2021年5月12日)-科學(xué)家正在迅速收集證據(jù)，證明腸道微生物群的變異體，我們消化系統(tǒng)中細(xì)菌和其他微生物的集合可能在糖尿病和其他疾病中發(fā)揮有害作用?，F(xiàn)在，喬斯林糖尿病中心的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了古代北美人的腸道微生物群與現(xiàn)代微生物群之間的巨大差異，為這些微生物如何隨著不同飲食而進(jìn)化提供了新的證據(jù)。

《自然》雜志高級作者，喬斯林助理研究員Aleksandar Kostic博士說，科學(xué)家分析了猶他州和墨西哥北部異常干燥的洞穴中土著人類古糞便(干燥的糞便)中發(fā)現(xiàn)的微生物DNA，并進(jìn)行了極高的基因組測序。

同時(shí)還是哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)助理教授的科斯提克說，這項(xiàng)研究比以前對古代人類腸道微生物群系的研究進(jìn)行了更廣泛，更深入的研究，是第一個(gè)揭示標(biāo)本中新型微生物物種的研究。

在先前對芬蘭和俄羅斯兒童的研究中，Kostic和他的同事們發(fā)現(xiàn)，與非工業(yè)化地區(qū)相比，工業(yè)化地區(qū)兒童患1型糖尿病的可能性要高得多。Kostic說：“我們能夠鑒定出特定的微生物和微生物產(chǎn)品，我們認(rèn)為這些微生物和微生物產(chǎn)品妨礙了他們早年進(jìn)行適當(dāng)?shù)拿庖呓逃?rdquo;“這導(dǎo)致以后不僅是1型糖尿病，而且還有其他自身免疫和過敏性疾病的高發(fā)事件。”

那么，在工業(yè)化產(chǎn)生影響之前，健康的人類微生物組會是什么樣?科斯蒂奇說：“我堅(jiān)信，任何現(xiàn)代生活的人都無法回答這個(gè)問題。”他指出，即使是亞馬遜偏遠(yuǎn)地區(qū)的部落也正在與Covid-19簽約。

史蒂文·勒布朗(Steven LeBlanc)是哈佛大學(xué)皮博迪考古與民族學(xué)博物館的一名考古學(xué)家，他以另一種引人注目的替代來源來到科斯蒂奇：博物館從北美西南干旱地區(qū)收集的人類古糞便樣本中發(fā)現(xiàn)了微生物DNA。

Kostic和研究生Marsha Wibowo接受了挑戰(zhàn)，最終將來自干燥洞穴(某些年代早于本世紀(jì)一世紀(jì))的八個(gè)保存完好的古腸樣品的DNA與789個(gè)現(xiàn)代樣品中的DNA進(jìn)行了比較。略有一半以上的現(xiàn)代樣本來自采用工業(yè)化“西方”飲食的人群，其余部分來自于食用非工業(yè)化食品的人群(主要在自己的社區(qū)內(nèi)生長)。

微生物組之間的差異是驚人的。例如，一種叫做丁氏螺旋體的細(xì)菌“不在我們分析的單個(gè)西方微生物組中，而是存在于八個(gè)古老微生物組中的每個(gè)微生物中，”科斯蒂克說。古代微生物群落確實(shí)與現(xiàn)代非工業(yè)微生物群落更加緊密地匹配。

令人驚訝的是，維博沃發(fā)現(xiàn)幾乎40%的古代微生物物種以前從未見過。是什么可以解釋這種高遺傳變異性?

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