西奈山轉(zhuǎn)化疾病模型中心的研究人員發(fā)布了一項(xiàng)開(kāi)創(chuàng)性的研究，確定了 4,749 個(gè)關(guān)鍵基因簇(稱(chēng)為“預(yù)后模塊”)，它們顯著影響 32 種不同類(lèi)型癌癥的進(jìn)展。該研究發(fā)表在《基因組研究》上，作為綜合資源，為開(kāi)發(fā)下一代癌癥治療和診斷標(biāo)記物奠定了基礎(chǔ)。
盡管癌癥研究取得了重大進(jìn)展，但了解該疾病的遺傳復(fù)雜性仍然具有挑戰(zhàn)性。先前的研究通常集中于特定癌癥類(lèi)型中孤立的基因功能。
我們的目標(biāo)是通過(guò)對(duì)各種癌癥形式的基因間相互作用進(jìn)行全面分析來(lái)填補(bǔ)這一知識(shí)空白。”
Bin 張博士，Willard TC Johnson 神經(jīng)遺傳學(xué)研究教授兼西奈山轉(zhuǎn)化性疾病模型中心主任
該團(tuán)隊(duì)使用多組學(xué)方法，將基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)納入分析中。他們采用先進(jìn)的系統(tǒng)生物學(xué)方法分析了來(lái)自最全面的公共癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)之一的癌癥基因組圖譜 (TCGA) 的 10,000 多個(gè)患者樣本，并使用嚴(yán)格的網(wǎng)絡(luò)方法來(lái)識(shí)別和驗(yàn)證對(duì)癌癥有重大影響的基因簇預(yù)后。
“我們的發(fā)現(xiàn)意義深遠(yuǎn)。我們已經(jīng)鑒定出 4,749 個(gè)不同的共同調(diào)控基因模塊，它們?cè)诎┌Y進(jìn)展中發(fā)揮著關(guān)鍵作用，”張博士解釋道。
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