洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院的研究人員開發(fā)了 GEMLI，這是一種開創(chuàng)性的工具，可以使我們研究細(xì)胞從胚胎狀態(tài)到在體內(nèi)發(fā)揮特殊作用的過程，以及它們在癌癥和其他疾病中的變化的研究方式民主化并極大地改善?！蹲匀煌ㄓ崱穲蟮懒诉@一進(jìn)展。
在錯綜復(fù)雜的生命之舞中，細(xì)胞繁殖和多樣化形成生物體的不同部分，了解每個細(xì)胞的起源至關(guān)重要。這就是生物學(xué)家所說的“細(xì)胞譜系”——細(xì)胞的家譜。正如您可以追溯到祖父母或更遠(yuǎn)的祖先一樣，科學(xué)家可以追蹤細(xì)胞如何分裂并從單個“親代”細(xì)胞進(jìn)化為各種“子代”細(xì)胞，每個子代細(xì)胞在體內(nèi)都有自己的作用。
追蹤細(xì)胞譜系有助于我們了解復(fù)雜的生物體(如人類)如何從單個受精卵發(fā)育成具有數(shù)萬億個特化細(xì)胞的生物，以及這個過程的破壞如何導(dǎo)致癌癥等疾病。然而，該領(lǐng)域面臨著一些重大障礙，主要是因?yàn)樽V系追蹤需要復(fù)雜且勞動密集型的技術(shù)。
杰姆利簡介
現(xiàn)在，由 EPFL 的 Almut Eisele 和 David Suter 領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家開發(fā)了一種計(jì)算工具，可以計(jì)算出細(xì)胞之間的譜系關(guān)系，而不需要專門的實(shí)驗(yàn)譜系追蹤方法。
該工具名為基于基因表達(dá)記憶的譜系推斷 (GEMLI)，僅需要單細(xì)胞 RNA 測序 (scRNA-seq) 數(shù)據(jù)，這是一種廣泛使用的技術(shù)，可捕獲單個細(xì)胞在任何時間表達(dá)的基因的“快照”。給定時間。
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