蛋白質(zhì)片段識別出兩種新的極端微生物

完美適應(yīng)的微生物生活在從深海海溝到山頂?shù)臉O端環(huán)境中。更多地了解這些極端微生物如何在惡劣的條件下生存，可以讓科學家了解地球上的生命和其他行星上潛在的生命。

在《蛋白質(zhì)組研究雜志》中，研究人員詳細介紹了一種基于蛋白質(zhì)片段而不是遺傳物質(zhì)來更準確地識別極端微生物的方法。該研究從智利高海拔湖泊(類似于早期火星的環(huán)境)中發(fā)現(xiàn)了兩種新的耐寒細菌。

盡管人類傾向于避免在極熱、極冷或高海拔地區(qū)定居，但一些微生物已經(jīng)適應(yīng)了在如此惡劣的地方生活。這些極端微生物引起了在其他行星上尋找生命的天體生物學家的興趣。

研究人員目前使用個體基因測序來根據(jù) DNA 識別地球上的微生物。然而，目前的方法無法區(qū)分密切相關(guān)的極端微生物物種。因此，拉爾夫·莫勒(Ralf Moeller)及其同事研究了是否可以通過使用其蛋白質(zhì)特征而不是基因序列來識別極端微生物。

研究人員開始使用來自智利高原海拔超過 2.3 英里的五個高海拔安第斯湖泊的水樣進行演示。(作為參考，丹佛海拔約一英里。)研究人員從樣本中培養(yǎng)了 66 種微生物，然后確定兩種方法中哪一種能更好地識別微生物：

傳統(tǒng)的基因測序?qū)⒚總€樣本的 16s rRNA 基因(基于序列的微生物分析的典型基因)的核苷酸與數(shù)據(jù)庫進行比較以進行識別。

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