獨特的基因特征可以幫助預測對化療的反應
弗朗西斯·克里克研究所的研究人員開發(fā)了一種方法,可以幫助預測肺癌患者是否會對化療產生反應,這取決于腫瘤中哪些基因被激活。
近年來,癌癥研究人員加深了我們對特定基因突變如何影響腫瘤發(fā)展、進化和對治療的反應的理解。然而,僅存在突變并不能提供腫瘤生物學的完整圖景。
在本周發(fā)表在《自然通訊》上的研究中,科學家們研究了腫瘤內不同基因的表達,這些基因被打開或關閉。
研究人員專注于與 RAS 信號通路相關的基因,分析了包含這些基因在癌細胞中的活性信息的數據集。從這些數據集中并在 AI 的幫助下,他們編制了84個基因的獨特基因特征。
當科學家們回顧性地查看來自 500 多名已經接受過治療的肺癌患者的數據時,基因特征能夠正確預測哪些患者會從化療中受益,哪些不會從化療中受益。
克里克癌癥基因生物學實驗室的共同主要作者和博士后研究科學家 Sophie de Carné 說:“由于提供了許多癌癥療法,并且有更多的藥物正在試驗中,因此預測哪種療法最有可能發(fā)生癌癥是一個挑戰(zhàn)。由于我們知道 RAS 信號傳導涉及各種耐藥機制,我們希望我們的基因特征將有助于確定可以從特定治療中受益的患者群體。
“與此同時,要實現這一目標還有很多工作要做。它需要在試驗環(huán)境中進行測試,我們也在對其進行調整,以期使其更易于部署。”
克里克癌癥基因生物學實驗室的共同主要作者和主要小組負責人 Julian Downward 說:“我們的工作表明,RAS 信號通路是解釋為什么肺癌患者對化療有不同反應的關鍵因素。. 該通路中的基因表達水平比某些基因突變(包括 KRAS 基因突變)的存在更具決定性。”
克里克生物信息學和生物統計學平臺的第一作者兼副負責人菲利普·伊斯特補充說:“由于先進的計算工具,我們可以利用大量現有的癌癥數據。這項研究展示了這些數據集如何帶來新的見解有可能改善患者的預后。”
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