對(duì)來(lái)自 23 個(gè)國(guó)家的 10,000 多種不同的結(jié)核分枝桿菌細(xì)菌分離物進(jìn)行的大規(guī)模分析揭示了與對(duì) 13 種一線和二線新抗生素和再利用抗生素的耐藥性相關(guān)的新基因。這項(xiàng)工作由結(jié)核病綜合耐藥性預(yù)測(cè)：一個(gè)國(guó)際聯(lián)盟 (CryPTIC) 進(jìn)行，在 8 月 11日發(fā)表在開(kāi)放獲取期刊PLOS Biology上的兩篇新論文中進(jìn)行了描述。
結(jié)核病 (TB) 是一種可治愈和可預(yù)防的疾病;85% 的受影響者可以通過(guò)六個(gè)月的藥物治療成功。盡管如此，近年來(lái)結(jié)核病導(dǎo)致的死亡人數(shù)比其他傳染病還多，耐藥結(jié)核病是一個(gè)持續(xù)的威脅。更好地了解賦予抗生素耐藥性的結(jié)核分枝桿菌變體對(duì)于更好地監(jiān)測(cè)耐藥菌株以及開(kāi)發(fā)新藥都很重要。
在第一篇新論文中，研究人員概述了他們?nèi)绾问占?12,289 個(gè)結(jié)核分枝桿菌分離株的開(kāi)放獲取數(shù)據(jù)綱要，并在世界各地的 CryPTIC 合作伙伴實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行處理。對(duì)每個(gè)分離株進(jìn)行測(cè)序，然后在具有不同濃度的 13 種抗菌劑的高通量網(wǎng)格上進(jìn)行測(cè)試。在該綱要收錄的樣本中，6,814 個(gè)樣本對(duì)至少一種藥物耐藥，其中 4,685 個(gè)樣本對(duì)多種藥物或一線治療利福平耐藥。
在第二篇論文中，該聯(lián)盟利用 10,228 個(gè)結(jié)核分枝桿菌分離株的數(shù)據(jù)展示了他們?cè)谌蚪M關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 中的發(fā)現(xiàn)。對(duì)于所有 13 種藥物，該小組發(fā)現(xiàn)了與最小抑制濃度顯著增加相關(guān)的未分類變體——即阻止結(jié)核分枝桿菌生長(zhǎng)的抗生素的最低濃度。分析這種濃度，而不是二元耐藥或不耐藥結(jié)果，可以識(shí)別出僅導(dǎo)致抗生素反應(yīng)發(fā)生細(xì)微變化的變體，這些變化可以通過(guò)增加藥物劑量來(lái)克服。研究人員選擇了對(duì)每種藥物產(chǎn)生耐藥性的 20 個(gè)最重要的基因，并更深入地描述了這些特定基因的效應(yīng)大小和變化。
“我們的研究證明了全球合作伙伴關(guān)系能夠顯著提高我們對(duì)與結(jié)核分枝桿菌耐藥性相關(guān)的遺傳變異的認(rèn)識(shí)，”作者指出。
總之，這些論文不僅揭示了可以跟進(jìn)的特定基因，以更好地了解結(jié)核分枝桿菌的耐藥性，而且還為未來(lái)病原體研究提供了框架。
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