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哥廷根大學研究團隊開發(fā)出完整基因數(shù)據(jù)的新方法

2022年1月4日整理發(fā)布:遺傳信息的使用對于現(xiàn)代植物育種是必不可少的。盡管自 2003 年首次解碼人類基因組以來,DNA 測序已經(jīng)變得便宜得多,但收集完整的遺傳信息仍然占動植物育種成本的很大一部分。降低這些成本的一個技巧是僅對基因組中非常小的隨機選擇部分進行測序,并使用數(shù)學和統(tǒng)計技術完成剩余的空白。哥廷根大學的一個跨學科研究團隊為此開發(fā)了一種新的方法論方法,該方法已發(fā)表在PLoS Genetics雜志上。

“該方法的核心思想是識別‘單倍型塊’,我們指的是基因組中由于遺傳而在不同植物中非常相似的較長部分,并使用這種鑲嵌結構來編譯其余信息,”哥廷根大學綜合育種研究中心的 Torsten Pook 博士說。“在繁殖種群中,使用這種新方法完成的序列質量堪比從 DNA 鏈中收集的信息量的 100 倍。”作為 MAZE 項目的一部分,研究人員的目標是培育不易受霜凍和干旱損害的玉米植物。該項目的合作伙伴 KWS Saat SE 已經(jīng)在育種計劃中使用該方法,因為它具有成本效益。

“另一個優(yōu)點是,該方法不僅使我們能夠檢測 DNA 鏈中單個核苷酸的差異,而且還能識別迄今為止實際上無法用于育種目的的結構差異,”Pook 說。然而,就目前情況而言,該方法目前只能有效地用于植物育種中的自交系。一項后續(xù)研究已計劃將該方法擴展到具有規(guī)則雙組染色體的生物體。這意味著他們的新方法可用于大多數(shù)脊椎動物,包括人類。

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