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古代基因組揭示的第一個(gè)鼠疫歷史記錄的細(xì)?

導(dǎo)讀 一個(gè)國際研究小組分析了來自21個(gè)考古遺址的人類遺骸,以進(jìn)一步了解鼠疫耶爾森菌在第一次(公元541-750年)中造成的影響和演變。在PNAS發(fā)表的

一個(gè)國際研究小組分析了來自21個(gè)考古遺址的人類遺骸,以進(jìn)一步了解鼠疫耶爾森菌在第一次(公元541-750年)中造成的影響和演變。在PNAS發(fā)表的一項(xiàng)研究中,研究人員重建了來自英國、德國、法國和西班牙的八個(gè)鼠疫基因組,揭示了以前未知的鼠疫菌株的多樣性水平。此外,他們還在英倫三島發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)賈絲汀尼安的直接基因證據(jù)。

查士丁尼始于公元541年的東羅馬帝國,由查士丁尼一世皇帝統(tǒng)治,并多次爆發(fā),蹂躪歐洲和地中海盆地約200年。同一時(shí)期的記錄描述了的范圍,據(jù)估計(jì),當(dāng)時(shí)多達(dá)25%的羅馬世界人口被消滅。最近的基因研究表明,鼠疫耶爾森菌是這種疾病的原因,但它是如何傳播的,以及在期間出現(xiàn)的菌株是如何相互關(guān)聯(lián)的,以前是未知的。

在目前的研究中,由馬克斯普朗克人類歷史科學(xué)研究所領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國際研究小組分析了奧地利、英國、德國、法國和西班牙21個(gè)地點(diǎn)的人類遺骸。他們能夠重建八個(gè)新的鼠疫耶爾森菌基因組,使他們能夠?qū)⑦@些菌株與以前發(fā)表的古代和現(xiàn)代基因組進(jìn)行比較。此外,研究小組還發(fā)現(xiàn)了英國最早的鼠疫基因證據(jù),這些證據(jù)來自阿克希爾的盎格魯-撒克遜遺址。根據(jù)考古年代測定和這種鼠疫耶爾森菌在其進(jìn)化樹中的位置,研究人員得出結(jié)論,基因組可能與公元544年不列顛群島上模糊描述的鼠疫有關(guān)。

第一個(gè)時(shí)期鼠疫菌株的高度多樣性

研究人員發(fā)現(xiàn),在6世紀(jì)到8世紀(jì)之間,歐洲有一種以前未知的鼠疫耶爾森菌多樣性。這八個(gè)新的基因組來自英國、法國、德國和西班牙?!皩ふ铱缭綇V泛地理和時(shí)間范圍的基因組為我們提供了一個(gè)機(jī)會來評估第一個(gè)時(shí)期歐洲鼠疫耶爾森菌的微觀多樣性,”共同第一作者馬塞爾凱勒解釋說,他是馬克斯普朗克研究所的博士生。人類歷史科學(xué),現(xiàn)在塔爾圖大學(xué)工作。新發(fā)現(xiàn)的基因組表明,在第一個(gè)的200年間,有許多密切相關(guān)的鼠疫耶爾森菌流行,其中一些可能在同一時(shí)間和同一地區(qū)。

雖然可用的基因組數(shù)量大大增加,但研究人員無法澄清查士丁尼的發(fā)病率?!霸诘谝粋€(gè)出現(xiàn)的幾百年前,這個(gè)譜系可能出現(xiàn)在中亞,但我們認(rèn)為目前的數(shù)據(jù)不足以解決茉莉花起源于人類的問題,這一問題最早是在公元541年在埃及報(bào)道的。然而,所有基因組都屬于同一譜系的事實(shí)表明,歐洲或地中海盆地的在此期間持續(xù)存在,而不是被多次重新引入。

兩次獨(dú)立的歷史流行病毒株趨同進(jìn)化的可能證據(jù)

這項(xiàng)研究的另一個(gè)有趣發(fā)現(xiàn)是,出現(xiàn)在第一個(gè)末期的鼠疫基因組在其遺傳密碼中顯示出大量缺陷,包括兩個(gè)毒力因子。大約800-1000年后,在第二個(gè)的晚期,鼠疫基因組顯示了覆蓋基因組相同區(qū)域的類似缺失?!斑@是趨同進(jìn)化的一個(gè)可能的例子,這意味著這些鼠疫菌株獨(dú)立進(jìn)化出了相似的特征。這種變化可能反映了對歐亞西部不同生態(tài)位的適應(yīng),在這兩次大流行期間,都在那里傳播,”Co首先解釋道。作者馬克斯普朗克人類歷史科學(xué)研究所的瑪麗亞斯皮魯。

目前的研究為歷史上首次記錄的鼠疫提供了新的見解,并提供了歷史、考古和古生物流行病學(xué)證據(jù)的其他線索,有助于回答懸而未決的問題。馬克斯普朗克人類歷史科學(xué)研究所高級作者約翰內(nèi)斯克勞斯解釋說:“這項(xiàng)研究通過比較幾千年來的基因組,展示了古生物學(xué)研究在理解歷史和現(xiàn)代大流行病方面的潛力。“通過對可能存在的鼠疫墓葬進(jìn)行更廣泛的采樣,我們希望有助于了解過去和現(xiàn)在大流行期間鼠疫的微觀演變及其對人類的影響?!?

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