研究及時(shí)為海灘季節(jié)提供基因組預(yù)警標(biāo)記
今天發(fā)表在開(kāi)放獲取期刊《GigaScience》上的一篇文章可能會(huì)讓你在計(jì)劃今年夏天去海灘時(shí)感到不安。本文介紹了三種不同水母的基因組草圖。
約瑟夫瑞安領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究小組選擇檢查水母的一系列物理特征和毒性水平(從輕微的煩惱到致命)——水母每年殺死的人比鯊魚(yú)、黃貂魚(yú)和海蛇還多。他們的研究確定了一系列與毒液相關(guān)的基因,為探索這些迷人動(dòng)物體內(nèi)毒素基因的進(jìn)化奠定了基礎(chǔ)。
被調(diào)查的三種水母是致命的有翼水母(Alatina alata)、解剖學(xué)上有趣的倒置水母(一種真正的水母:仙后座水母)和水母(Calvadosia Cruxmelitens),后者以其刺狀器官而聞名。模式。這里的工作最終提供了所有五個(gè)譜系中胚層(棘皮動(dòng)物亞門(mén))的基因組序列。
通過(guò)這些新的基因組,我們第一次可以比較所有五種棘皮動(dòng)物(珊瑚蟲(chóng)、水螅蟲(chóng)、寬體棘皮動(dòng)物、十字棘皮動(dòng)物、擬棘皮動(dòng)物)的基因含量。這項(xiàng)廣泛的調(diào)查提供了一個(gè)重要的總覽,進(jìn)化的中樞神經(jīng)系統(tǒng)基因組。"
與有毒脊椎動(dòng)物毒理學(xué)研究進(jìn)展相比,棘皮動(dòng)物毒理學(xué)研究因缺乏廣泛的遺傳信息而受到阻礙。因?yàn)橄湫嗡笇?duì)海灘觀(guān)眾來(lái)說(shuō)是致命的,所以刺痛動(dòng)物毒液的區(qū)域特別有趣:每年大約有100人死于咬傷。他們被認(rèn)為是非常危險(xiǎn)的。它們是美國(guó)天氣報(bào)告中唯一有自己分類(lèi)的水母。
為了研究毒素,作者鑒定了117種推測(cè)的毒液蛋白,其中9種僅在棘皮動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)。有翼水母基因組是唯一一個(gè)含有一種叫做CqTx的毒素基因的基因組。CqTx蛋白在細(xì)胞膜上產(chǎn)生孔隙,導(dǎo)致溶血和紅細(xì)胞分解。由于一些盒水母可以在5分鐘內(nèi)停止某人的心臟,識(shí)別有翼水母盒中的這種毒素增加了另一個(gè)線(xiàn)索,那就是人們是如何死于盒水母的刺痛的,現(xiàn)在還不清楚。
基因組比較也揭示了關(guān)于刺狀動(dòng)物毒液進(jìn)化的信息?;騺G失和基因復(fù)制在物種進(jìn)化中都起著重要作用。例如,科學(xué)家對(duì)另一種毒素基因CrTx的分析顯示了這兩種情況。倒置的水母含有一個(gè)單一的CrTx基因,帶翅膀的水母盒有這個(gè)基因的5個(gè)拷貝;而偷偷靠近的水母卻沒(méi)有。
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