新的生物信息學(xué)工具發(fā)現(xiàn)了威脅水產(chǎn)養(yǎng)殖中天然羅非魚種群生存的雜交魚

一種新的基因組學(xué)標(biāo)記工具已被證明可以準(zhǔn)確識(shí)別羅非魚種類并區(qū)分它們的雜交品種，為幫助非洲坦桑尼亞發(fā)展水產(chǎn)養(yǎng)殖和加強(qiáng)保護(hù)提供了一種新資源。

至關(guān)重要的是，新工具提供了比全基因組數(shù)據(jù)分析更便宜的解決方案——目前監(jiān)測當(dāng)?shù)厣锒鄻有缘姆椒ā?/p>

由LED阿勒姆研究所，沿著坦桑尼亞水產(chǎn)研究所，羅漢普頓大學(xué)，班戈大學(xué)，在英國布里斯托爾大學(xué)和東安格利亞大學(xué)在英國，新的基因組標(biāo)記工具使侵入和本地羅非魚之間的羅非魚品種鑒定和精確定位雜交物種。

近幾十年來，熱帶內(nèi)陸水產(chǎn)養(yǎng)殖產(chǎn)量迅速增加，2018 年達(dá)到 4,700 萬噸。 羅非魚是一種以O(shè)reochromis屬為主并原產(chǎn)于非洲和中東的慈鯛魚群，是這一擴(kuò)張的關(guān)鍵部分——占 550 萬噸噸的全球總量。內(nèi)陸水產(chǎn)養(yǎng)殖的持續(xù)擴(kuò)張?jiān)诜侵抻葹橹匾?，那里的氣候變化和人口增長使脆弱的糧食生產(chǎn)系統(tǒng)面臨更大的壓力。

由于氣候變化導(dǎo)致內(nèi)陸水域溫度逐漸升高，非洲漁業(yè)遭受相關(guān)的水生環(huán)境物理和化學(xué)變化。再加上人口持續(xù)增長，預(yù)計(jì)到 2100 年，撒哈拉以南非洲和亞洲的人口將達(dá)到 90 億，進(jìn)一步引起人們對糧食安全的擔(dān)憂。

羅非魚是非洲特有的，包括坦桑尼亞在內(nèi)的東非是羅非魚物種自然多樣性的熱點(diǎn)地區(qū)。在坦桑尼亞發(fā)現(xiàn)了至少 8種完全地方性的Oreochromis物種，另外還有 12 種是與鄰國共享的集水區(qū)特有的物種。其中一些物種適應(yīng)了獨(dú)特的環(huán)境條件，如高溫、鹽度和 pH 值，可能對未來的水產(chǎn)養(yǎng)殖發(fā)展感興趣。

主要作者、厄勒姆研究所 Haerty 小組的博士后科學(xué)家 Adam Ciezarek 博士說：“羅非魚養(yǎng)殖的主要困難之一在于物種的歧視。目前，這依賴于形態(tài)特征，這在雌性和幼魚中尤其難以識(shí)別。這反過來又會(huì)導(dǎo)致意外的庫存污染。此外，眾所周知，非本地養(yǎng)殖的羅非魚種群(尼羅羅非魚、O. niloticus)廣泛分布于整個(gè)非洲并與本地Oreochromis物種雜交。

“為了滿足準(zhǔn)確區(qū)分物種的需要，同時(shí)也需要確定可以經(jīng)濟(jì)高效且更快地進(jìn)行的潛在雜交，開發(fā)了一種基于 96 個(gè)單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 生物標(biāo)志物的優(yōu)化設(shè)計(jì)。這種設(shè)計(jì)也被證明比微衛(wèi)星或種間雜種的形態(tài)識(shí)別更準(zhǔn)確。

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