尋求對(duì)所有動(dòng)物的基因組進(jìn)行測(cè)序的巨大差距

華盛頓州普爾曼——根據(jù)華盛頓州立大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)分析，對(duì)世界動(dòng)物基因組進(jìn)行測(cè)序的努力往往集中在那些與人類最相似的動(dòng)物身上，而這項(xiàng)工作幾乎完全在全球北部進(jìn)行。

在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》上發(fā)表的一篇論文中，來(lái)自 WSU 和楊百翰大學(xué)的研究人員警告說(shuō)，目前的努力忽視了大量的多樣性和機(jī)會(huì)。

分析發(fā)現(xiàn)，近 3,300 種動(dòng)物物種的基因組已被測(cè)序和組裝，這一過(guò)程為生物體的 DNA 提供了組織背景。雖然這個(gè)速度正在加快，但與世界上 166 萬(wàn)種動(dòng)物相比，這個(gè)數(shù)字很小，而脊椎動(dòng)物占當(dāng)前序列的最大份額。盡管僅代表動(dòng)物物種的 3.9%，但它們占所有集會(huì)的 54%。相比之下，節(jié)肢動(dòng)物門的無(wú)脊椎動(dòng)物(包括昆蟲和蜘蛛)僅占當(dāng)前數(shù)據(jù)集的 34%，而占所有物種的 78.5%。

“隨著基因組組裝的迅速積累，我們想考慮我們的努力在哪里。它并沒(méi)有均勻地分布在整個(gè)動(dòng)物生命之樹上，”主要作者、WSU 博士后研究員 Scott Hotaling 說(shuō)。“無(wú)脊椎動(dòng)物的代表性仍然非常低，考慮到人們似乎更關(guān)心脊椎動(dòng)物，即所謂的‘有魅力的巨型動(dòng)物群’，這是有道理的。”

包括類人猿和人類在內(nèi)的人科擁有最連續(xù)的基因組數(shù)據(jù)，但人類基因組并不是最長(zhǎng)的：這個(gè)稱號(hào)屬于澳大利亞肺魚。在所有基因組數(shù)據(jù)中，只有五個(gè)節(jié)肢動(dòng)物群得到了很好的代表：蜜蜂、蝴蝶、蚊子、果蠅和螞蟻——所有這些都以它們對(duì)人類造成的效用或問(wèn)題而著稱。

“我們對(duì)自己感興趣，這不一定是件壞事，”該論文的通訊作者、楊百翰大學(xué)助理教授保羅弗蘭德森說(shuō)。“但要開始了解整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)，我們必須開始對(duì)更多種類的生命進(jìn)行采樣，以獲得更清晰的圖景。脊椎動(dòng)物是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分，但可以說(shuō)昆蟲和許多其他小生物可能扮演更重要的角色，因?yàn)樗鼈兲幱谑澄锞W(wǎng)的底部。”

作者 Hotaling、Frandsen 和 WSU 副教授 Joanna Kelley 還指出，絕大多數(shù)基因測(cè)序工作發(fā)生在通常稱為全球北部的發(fā)達(dá)國(guó)家，因?yàn)榇蠖鄶?shù)位于北半球。美國(guó)、中國(guó)和瑞士這三個(gè)國(guó)家的產(chǎn)量最多。不同地區(qū)甚至有某些傾向，其中北美對(duì)哺乳動(dòng)物和昆蟲進(jìn)行了最多的測(cè)序，歐洲對(duì)魚類進(jìn)行了排序，亞洲對(duì)鳥類進(jìn)行了排序。

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