多機構(gòu)研究團隊開發(fā)了一種方法，可以快速、無創(chuàng)地測試已知有益于珊瑚的細菌種類——他們測試珊瑚附近的海水。他們的方法于 7 月 18 日首次在線發(fā)表在《海洋生物技術(shù)》上，并登上了該雜志8 月印刷版的封面。
“一些珊瑚相關(guān)細菌被認為是保護珊瑚的益生菌，為了開發(fā)珊瑚益生菌，收集這些細菌進行進一步研究很重要，”論文作者、生命與環(huán)境研究生院助理教授 Natsuko Miura 說。大阪府立大學(xué)理學(xué)部。
她還指出，檢測和識別細菌是檢查珊瑚菌群平衡的關(guān)鍵，即任何生物體上存在的細菌的集體平衡。
“此前，研究人員建議，珊瑚周圍海水中微生物菌群的組成可以用作環(huán)境指標(biāo)，”三浦說，并解釋說，挑戰(zhàn)在于確定海水中細菌的分布究竟如何反映珊瑚的健康狀況。“為了更好地理解這一點，我們從珊瑚中收集和分析細菌。但是，在以前的收集方法中，珊瑚相關(guān)細菌是通過破壞珊瑚體獲得的。我們認為為了保護珊瑚而破壞珊瑚是有問題的。”
研究人員著手開發(fā)一種快速檢測方法，以識別從珊瑚礁周圍采集的海水樣本中的有益細菌。他們專注于Galaxea fascicularis，這是一種在沖繩瀨底島海岸發(fā)現(xiàn)的造礁珊瑚。物種Ruegeria細菌被認為提供這種珊瑚益生菌的好處，如維生素B12生產(chǎn)和防范一些病原體，根據(jù)三浦。
通常，為了識別特定物種，研究人員使用稱為引物的兩個定義的遺傳密碼片段來靶向和分離所需的更長的遺傳序列。一旦分離，該序列可以被復(fù)制和擴增足夠大的數(shù)量以匹配單個物種。通常，潛在的引物是根據(jù)各種遺傳因素提出的，但需要驗證。
除了新開發(fā)的引物外，Miura 和她的團隊還假設(shè)，2020 年提出的 55 種引物中的兩種引物的物理特性是驗證此開發(fā)期間海水含量所需的，可以可靠地識別海水樣本中的Ruegeria物種，并幾個小時內(nèi)從瀨底島周圍的珊瑚。他們是對的。
“我們的結(jié)果表明，這種特定的引物組可以輕松快速地分離特定細菌種類，促進感興趣細菌的分離，”Miura 說，并補充說，他們發(fā)現(xiàn)珊瑚中Ruegeria種類的濃度高于海水中的濃度，這表明細菌可能集中在珊瑚中。“雖然需要進一步的研究來確定珊瑚和海水中細菌豐度的差異，但新開發(fā)的方法可以更容易地快速檢查珊瑚周圍的海水是否在不破壞珊瑚的情況下獲得了有益的珊瑚相關(guān)細菌。”
Miura 表示，研究人員現(xiàn)在正在向公共存儲庫提供已鑒定細菌物種的樣本，希望其他人能夠擴大和加速這項工作，以更好地了解和使用珊瑚益生菌。
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