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研究為關鍵轉錄因子如何管理對 DNA 的訪問提供了證據(jù)

導讀 CTCF 是一種轉錄因子,因其在調節(jié)稱為MYC的關鍵癌基因中的作用而成為研究目標。圣裘德兒童研究醫(yī)院的科學家們發(fā)現(xiàn)了直接證據(jù),表明 CTCF

CTCF 是一種轉錄因子,因其在調節(jié)稱為MYC的關鍵癌基因中的作用而成為研究目標。圣裘德兒童研究醫(yī)院的科學家們發(fā)現(xiàn)了直接證據(jù),表明 CTCF 控制著染色質的可及性,即打開緊密纏繞的 DNA 以便表達基因的過程。研究結果發(fā)表在基因組生物學上。

CTCF 被生物學家稱為基因組的主要調節(jié)器,并因嚴重影響基因組的 3D 結構而聞名。導致其缺失的 CTCF 突變很少見;然而,影響它如何與基因和蛋白質結合的突變在患有癌癥等疾病的細胞中很常見。雖然對 CTCF 對基因的下游影響進行了深入研究,但對更直接的影響知之甚少。

“我們對 CTCF 的直接作用的認識存在空白,這對于理解轉錄過程很重要,”資深和共同通訊作者李春良博士說,圣裘德腫瘤細胞生物學系.“如果你在正確的時間和地點改變基因表達,那么即使是適度的轉錄變化也會導致疾病發(fā)展發(fā)生重大變化。”

新技術引領潮流

研究人員使用尖端技術和多學科方法,利用生長素誘導的 degron 系統(tǒng)。生長素誘導的 degron 系統(tǒng)是一種在短時間內以靶向方式降解蛋白質的技術,使研究人員能夠更好地了解其主要功能。這些工具對于研究 CTCF 蛋白的急性消耗如何影響細胞是必要的。

“區(qū)分 CTCF 的真正生物學具有挑戰(zhàn)性,但我們已經(jīng)使用這些工具提供了直接證據(jù),證明 CTCF 調節(jié)染色質的可及性,并為該領域提供清晰度,”共同第一和共同通訊作者徐北思博士說。 .D.,圣裘德應用生物信息學中心。

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