通過大數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)癌癥免疫反應(yīng)的遺傳驅(qū)動(dòng)因素

桑福德伯納姆普雷比斯醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)研究所 (SBP) 的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了 100 多個(gè)影響癌癥免疫反應(yīng)的新基因區(qū)域。該研究結(jié)果發(fā)表在《癌癥免疫學(xué)研究》上，可以為未來免疫療法的發(fā)展提供信息，即增強(qiáng)免疫系統(tǒng)殺死腫瘤能力的治療方法。

“通過分析大型公共基因組數(shù)據(jù)庫，我們發(fā)現(xiàn)了 122 個(gè)潛在的免疫反應(yīng)驅(qū)動(dòng)因素——其中突變與浸潤腫瘤的免疫細(xì)胞的存在或不存在相關(guān)的基因區(qū)域，”該研究的主要作者 Eduard Porta-Pardo 博士說。 SBP 博士后研究員。“雖然其中一些對(duì)應(yīng)于在免疫反應(yīng)中具有已知作用的蛋白質(zhì)，但許多其他蛋白質(zhì)為癌癥免疫學(xué)研究提供了新方向，這可能為免疫治療指明新的靶標(biāo)。”

免疫療法被譽(yù)為癌癥的轉(zhuǎn)折點(diǎn)，因?yàn)樗踔量梢灾委熞褦U(kuò)散到其他器官的晚期病例。此類藥物目前已被廣泛使用，并且常常取得顯著的成功，可以根除或顯著縮小腫瘤并預(yù)防復(fù)發(fā)。

目前大多數(shù)免疫療法都依賴于類似的策略——釋放免疫系統(tǒng)的剎車。如果腫瘤被免疫系統(tǒng)識(shí)別為威脅并允許免疫細(xì)胞浸潤，那么這些治療方法是有效的，但一些癌癥仍然處于隱蔽狀態(tài)或以未知的方式阻止免疫細(xì)胞進(jìn)入腫瘤。

“為了開發(fā)與多種癌癥相關(guān)的免疫療法，我們需要更多地了解免疫系統(tǒng)如何與腫瘤相互作用，”生物信息學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)項(xiàng)目教授兼主任 Adam Godzik 博士說和該研究的資深作者。“我們的研究為這一努力提供了許多新的線索。”

Porta-Pardo 評(píng)論道：“我們正在以精細(xì)的分辨率探索癌癥突變，因?yàn)橥蛔兛梢砸圆煌姆绞接绊懢幋a的蛋白質(zhì)，具體取決于所產(chǎn)生的變化所在的位置。”“我們的算法，domainXplorer，可以識(shí)別表型(在本例中是腫瘤中免疫細(xì)胞的數(shù)量)與單個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域(具有不同功能的蛋白質(zhì)部分)的突變之間的相關(guān)性。

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