當您想到理想的社區(qū)時，您可能會想到綠樹成蔭的街道或互相幫助的緊密社區(qū)。您可能沒有考慮您的消化系統(tǒng)。
但也許你應該這樣做。根據(jù)斯坦福大學醫(yī)學院研究人員領導的一組科學家的說法，確實存在不同細胞類型的“鄰域”，它們可以合作消化食物并保護您免受感染等，而這些鄰域的新的超高分辨率地圖證明您的腸道在功能上和視覺上都令人印象深刻。
就像人類社區(qū)具有不同數(shù)量的街道、餐館和房屋等共同元素一樣，細胞社區(qū)也是由不同數(shù)量的具有特定功能的細胞類型組成。通過結(jié)合幾種新的成像和測序技術(shù)，研究人員能夠?qū)⑦@些鄰域映射到單個細胞的水平。
“這是第一次有人在單細胞水平上繪制腸道空間圖，”遺傳學教授兼主席、該研究的共同高級作者 Michael Snyder 博士說，該研究于 7 月 19 日發(fā)表在《自然》雜志上。“這有點像探索一個新星球，因為我們不確切知道我們會發(fā)現(xiàn)什么細胞類型或它們將如何組織。”
繪制腸道圖
來自斯坦福大學醫(yī)學院和其他機構(gòu)多個實驗室的研究人員參與了這項新的繪圖工作，這是美國國立衛(wèi)生研究院創(chuàng)立的人類生物分子圖譜計劃的一部分。該項目的科學家們旨在創(chuàng)建一個全面的人體細胞圖譜。
為了繪制腸道圖，科學家檢查了九名已故捐贈者的小腸和大腸的八個區(qū)域。研究人員使用一種稱為索引聯(lián)合檢測(CODEX)的技術(shù)，該技術(shù)涉及用熒光抗體(結(jié)合某些蛋白質(zhì)并實現(xiàn)成像的物質(zhì))反復染色和清洗組織，根據(jù)每種細胞類型的相對豐度識別出 20 種不同的細胞鄰域。
對一些樣品中的 RNA 和染色體材料進行的額外分子分析提供了每種細胞類型的更詳細信息。
“我們的圖譜旨在成為健康腸道的參考，我們可以用它來比較從腸易激疾病到早期結(jié)腸癌的所有疾病，”斯坦福大學 W. Ascherman 醫(yī)學博士、FACS 遺傳學教授 Snyder 說。“這將為我們了解各種消化系統(tǒng)疾病奠定基礎。”
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