新構(gòu)建的慢性淋巴細(xì)胞白血病 (CLL) 遺傳變化圖譜是一種血液和骨髓癌癥，以多種形式存在并由各種原因引起，可以更好地了解這種可能導(dǎo)致的復(fù)雜惡性腫瘤為患者提供更準(zhǔn)確的預(yù)后、改進(jìn)的診斷方法和新的治療方法。這項工作發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》上，由國際研究人員合作進(jìn)行，其中包括來自麻省總癌癥中心、達(dá)納-法伯癌癥研究所以及麻省理工學(xué)院和哈佛博德研究所的團(tuán)隊。
CLL 以緩慢或快速生長的癌癥形式存在，并與某些基因突變有關(guān)，但尚未完全表征。以前的分析只提供了 CLL“地圖”的片段，每個都側(cè)重于特定類型的患者或有限的數(shù)據(jù)。為了更透徹地了解 CLL 及其分子亞型的生物學(xué)基礎(chǔ)，科學(xué)家們著手從迄今為止最大的 CLL 數(shù)據(jù)集構(gòu)建地圖。
為了構(gòu)建 CLL 圖，該團(tuán)隊分析了來自 1,148 名患者的基因序列、基因表達(dá)模式和對 DNA 或基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)的化學(xué)修飾的變異。“這樣的 CLL 圖最終可以在臨床中使用，其中新患者的基因組特征可以與具有相似遺傳特征的患者的治療和結(jié)果進(jìn)行比較，”共同高級和共同通訊作者 Catherine Wu 醫(yī)學(xué)博士說，達(dá)納-法伯癌癥研究所干細(xì)胞移植和細(xì)胞治療部主任，哈佛醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)教授。“這種分析可能有助于根據(jù)新患者的特定分子特征更準(zhǔn)確地調(diào)整預(yù)后和治療，從而更接近精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)。”
科學(xué)家們確定了 202 個基因(其中 109 個是新基因)，這些基因在發(fā)生突變時可能會驅(qū)動 CLL，他們改進(jìn)了具有不同基因組特征和預(yù)后的 CLL 亞型的表征。除了基因序列，某些基因的表達(dá)模式進(jìn)一步細(xì)分了 CLL 并提供了有價值的預(yù)后信息。“我們的研究表明，CLL 的遺傳和生物學(xué)情況比以前認(rèn)為的要復(fù)雜得多，”麻省總癌癥中心生物信息學(xué)主任和醫(yī)學(xué)研究中心主任、共同通訊作者 Gad Getz 博士說。 Broad研究所的癌癥基因組計算分析小組。
患者的臨床結(jié)果與基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組特征的組合相關(guān)，因此整合這些數(shù)據(jù)可以預(yù)測患者出現(xiàn)緩解與發(fā)展為更晚期癌癥的可能性。
“我們正在發(fā)布一個基于 CLL 地圖的 CLL 地圖‘門戶’，它將成為一個交互式網(wǎng)站，供轉(zhuǎn)化研究人員用作進(jìn)一步調(diào)查的資源——例如了解更多關(guān)于不同驅(qū)動因素和 CLL 亞型的信息，”說蓋茨。
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