多基因風(fēng)險評分 (PRS) 是預(yù)測疾病風(fēng)險的有前途的工具，但當(dāng)前版本具有內(nèi)在偏差，可能會影響其在某些人群中的準(zhǔn)確性并導(dǎo)致健康差異。然而，來自麻省總醫(yī)院 (MGH)、麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)博德研究所以及中國上海上海交通大學(xué)的一組研究人員設(shè)計了一種生成 PRS 的新方法，該方法可以更準(zhǔn)確地預(yù)測人群中的疾病風(fēng)險，他們在《自然遺傳學(xué)》中報道。
基因 DNA 序列的改變會產(chǎn)生增加疾病風(fēng)險的遺傳變異。一些遺傳變異與某些疾病密切相關(guān)，例如 BRCA1 突變和乳腺癌。“然而，最常見的人類疾病——如 2 型糖尿病、高血壓例如，抑郁癥不是受單個基因的影響，而是受整個基因組中成百上千個基因變異的影響。每個變體都會產(chǎn)生很小的影響，”MGH 基因組醫(yī)學(xué)中心精神病學(xué)和神經(jīng)發(fā)育遺傳學(xué)部門的應(yīng)用數(shù)學(xué)家和生物統(tǒng)計學(xué)家、該論文的共同資深作者 Tian Ge 博士說。PRS 匯總了這些影響基因組中的遺傳變異，并已顯示有希望用于預(yù)測個體患者發(fā)展疾病的機(jī)會。這將使臨床醫(yī)生能夠推薦預(yù)防措施并密切監(jiān)測患者以進(jìn)行早期診斷和干預(yù)。
然而，PRS 必須經(jīng)過“訓(xùn)練”以使用從大量個體中收集基因組信息的研究中的數(shù)據(jù)來預(yù)測疾病風(fēng)險。Ge 解釋說，雖然許多致病變異是共享的，但不同血統(tǒng)的個體之間疾病的遺傳基礎(chǔ)存在重要差異。例如，與一個人群中的特定疾病相關(guān)的常見遺傳變異在其他人群中可能具有較低的頻率甚至缺失。Ge解釋說，當(dāng)與疾病相關(guān)的遺傳變異在不同人群中共享時，其影響大小或增加風(fēng)險的程度也可能因祖先群體而異。使用來自一個人群的數(shù)據(jù)訓(xùn)練 PRS因此，當(dāng)應(yīng)用于其他人群時，通常會減弱或降低性能。
“現(xiàn)有 PRS 計算方法的一個主要問題是，迄今為止，大多數(shù)基因組研究都使用從歐洲血統(tǒng)個體收集的數(shù)據(jù)，”Ge 說。他說，這在現(xiàn)有的 PRS 中造成了以歐洲為中心的偏見，從而產(chǎn)生了準(zhǔn)確度大大降低的預(yù)測，并增加了他們高估或低估非歐洲人群疾病風(fēng)險的可能性。
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