新的機器學(xué)習(xí)方法更擅長發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)中的酶金屬

勞倫斯——上賽季，堪薩斯城酋長隊四分衛(wèi)帕特里克·馬霍姆斯的傳球完成率為 66.3。

但是，與 MAHOMES 的準(zhǔn)確性相比，Mahomes 令人印象深刻的統(tǒng)計數(shù)據(jù)相形見絀，這是一種由堪薩斯大學(xué)開發(fā)的機器學(xué)習(xí)模型 MAHOMES -友好且便宜的藥物療法和其他工業(yè)產(chǎn)品。

MAHOMES 不是針對廣泛的接收器，而是以 92.2% 的準(zhǔn)確率區(qū)分蛋白質(zhì)中的酶促金屬和非酶促金屬。KU 的一個團隊最近在Nature Communications上發(fā)表了關(guān)于這種區(qū)分酶的機器學(xué)習(xí)方法的結(jié)果。

“酶是非常有趣的蛋白質(zhì)，可以完成所有化學(xué)反應(yīng)——酶對某物進行化學(xué)反應(yīng)，將其從一種東西轉(zhuǎn)化為另一種東西，”相應(yīng)作者、KU 分子生物科學(xué)和計算生物學(xué)副教授喬安娜·斯盧斯基 (Joanna Slusky) 說。“你帶進你身體的一切，你的身體都會把它分解成新的東西，分解成新東西的過程——所有這一切都歸功于酶。”

Slusky 和她實驗室的研究生合作者Ryan Feehan(命名 MAHOMES 的酋長隊球迷)和 KU計算生物學(xué)中心的Meghan Franklin試圖使用計算機來區(qū)分不進行化學(xué)反應(yīng)的金屬蛋白和金屬酶以驚人的力量和效率促進化學(xué)反應(yīng)。

問題是金屬蛋白和金屬酶在許多方面是相同的。

“人們并不完全了解酶的工作原理，”Slusky 說。“對于任何給定的酶，你可以說，'好吧，你知道，它會去掉這個氫并帶上 -OH 基團，'或者它所做的任何事情。但如果我給你一種你以前從未見過的蛋白質(zhì)，然后我問，‘最后會怎樣?哪一邊會產(chǎn)生反應(yīng)?”作為科學(xué)家，甚至作為酶學(xué)家，您可能無法告訴我。現(xiàn)在，其中一個關(guān)鍵是大約 40% 的酶使用金屬進行催化——因此它們的蛋白質(zhì)與金屬結(jié)合，然后發(fā)生變化的任何東西都會進入該活性位點并發(fā)生變化。我們看到這些金屬結(jié)合蛋白和金屬酶，它們是結(jié)合金屬的酶，

　　免責(zé)聲明：本文由用戶上傳，與本網(wǎng)站立場無關(guān)。財經(jīng)信息僅供讀者參考，并不構(gòu)成投資建議。投資者據(jù)此操作，風(fēng)險自擔(dān)。 如有侵權(quán)請聯(lián)系刪除！