Omicron遺傳學(xué)和早期傳播模式的特征

根據(jù)一項(xiàng)研究，由于適應(yīng)性進(jìn)化，SARS-CoV-2 的 omicron 變體與以前的 SARS-CoV-2 變體不同，其中有益的突變通過自然選擇而不是通過以前變體之間的重組傳遞給后代。龐大的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)。該研究最近發(fā)表在《自然》雜志上，首次描述了 omicron 的基因組譜并探索了該變體的起源。

生物學(xué)副教授 Maciej Boni 說：“我們已經(jīng)看到 SARS-CoV-2 在大約 16 個(gè)月內(nèi)產(chǎn)生了三種主要變體——alpha、delta 和omicron，這非常令人驚訝，因?yàn)槠渌《静粫?huì)進(jìn)行如此重復(fù)的大進(jìn)化飛躍。” ，賓夕法尼亞州立大學(xué)，他領(lǐng)導(dǎo)了這項(xiàng)全球合作的重組分析。“最新的變種——omicron——之所以非同尋常，是因?yàn)樗谄浯掏坏鞍椎倪M(jìn)化過程中實(shí)現(xiàn)了更大的飛躍。”

Boni 指出，與以前的變體相比，omicron 的刺突蛋白有 30 多個(gè)突變，其中許多已知會(huì)影響宿主抗體的中和。

“鑒于 omicron 在進(jìn)化上取得了如此大的飛躍，我們想調(diào)查這可能發(fā)生的原因和方式，”他說。

為此，由南非流行病應(yīng)對(duì)與創(chuàng)新中心領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)分析了截至 2021 年 12 月 7 日可用的所有 686 個(gè) omicron 序列。他們發(fā)現(xiàn) omicron 屬于 B.1.1 譜系，其中還包括 alpha 變體。有趣的是，該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn) omicron 在基因上不同于 alpha，以及任何其他已知的感興趣的變體。

“這意味著，盡管 omicron 與 alpha 變體屬于同一血統(tǒng)，但它已經(jīng)發(fā)生了很大的變化，以至于它在很大程度上無(wú)法識(shí)別為 alpha 變體的表親或侄子，”Boni 說。“當(dāng)首次對(duì) omicron 基因組進(jìn)行測(cè)序時(shí)，很明顯這種病毒有可能在表型上與我們熟悉的以前的 SARS-CoV-2 變體非常不同。”

為了確定 omicron 變體何時(shí)首次出現(xiàn)，該團(tuán)隊(duì)使用了一種稱為時(shí)間校準(zhǔn)貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育分析的技術(shù)。他們估計(jì)，所有 omicron 的最近共同祖先存在的日期是 2021 年 10 月上旬。

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