UBC 醫(yī)學(xué)院的研究人員對 Omicron 變異刺突蛋白進行了世界上第一個分子水平的結(jié)構(gòu)分析。研究結(jié)果今天發(fā)表在《科學(xué)》雜志上。
使用低溫電子顯微鏡以近原子分辨率進行的分析揭示了嚴重突變的 Omicron 變體如何附著并感染人體細胞。
“了解病毒刺突蛋白的分子結(jié)構(gòu)很重要,因為它將使我們能夠在未來開發(fā)出針對 Omicron 和相關(guān)變體的更有效的治療方法,”主要作者、UBC 系教授 Sriram Subramaniam 博士(他/他)說。生物化學(xué)和分子生物學(xué)。“通過分析病毒感染人體細胞的機制,我們可以開發(fā)出更好的治療方法來破壞這一過程并中和病毒。”
位于外部的刺突蛋白使 SARS-CoV-2 能夠進入人體細胞。Omicron 變體在其刺突蛋白上具有史無前例的 37 個突變,是以前的變體的三到五倍。
結(jié)構(gòu)分析顯示,幾個突變(R493、S496 和 R498)在刺突蛋白和人類細胞受體 ACE2 之間產(chǎn)生了新的鹽橋和氫鍵。研究人員得出結(jié)論,這些新鍵似乎增加了結(jié)合親和力——病毒與人體細胞的結(jié)合強度——而其他突變(K417N)降低了這種鍵的強度。
“總體而言,研究結(jié)果表明,Omicron 比原始病毒具有更高的結(jié)合親和力,其水平與我們看到的 Delta 變體更具可比性,”Subramaniam 博士說。“值得注意的是,盡管有如此廣泛的突變,Omicron 變體仍能保持與人類細胞結(jié)合的能力。”
研究人員進行了進一步的實驗,表明 Omicron 刺突蛋白表現(xiàn)出增加的抗體逃避。與之前的變體相比,Omicron 顯示出對所有六種單克隆抗體的可測量逃避,完全逃避了五種。該變體還顯示出對從接種疫苗的個體和未接種疫苗的 患者收集的抗體的逃避增加。
“值得注意的是,與未接種疫苗的患者對自然感染的免疫力相比,Omicron 對疫苗產(chǎn)生的免疫力的逃避程度較低。這表明疫苗接種仍然是我們最好的防御措施,”Subramaniam 博士說?;谟^察到的結(jié)合親和力和抗體逃避的增加,研究人員說,刺突蛋白突變可能是導(dǎo)致 Omicron 變體傳播能力增加的因素。
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