德克薩斯大學奧斯汀分校海洋科學研究所的科學家發(fā)現了近22種新型微生物,其中許多微生物利用甲烷和丁烷等碳氫化合物作為能源生存和生長——這意味著新發(fā)現的細菌可能有助于限制大氣中溫室氣體的濃度,并有朝一日可能用于清理漏油。
在《自然通訊》本周發(fā)表的一篇論文中,研究人員記錄了生活在加利福尼亞灣瓜伊馬斯盆地極熱深海沉積物中的微生物群落的廣泛多樣性。該團隊發(fā)現了新的微生物物種,它們不同于以前研究的遺傳學,代表了生命之樹的新分支。這些物種中的許多有敏銳的能力吃污染物,就像以前在海洋和土壤中發(fā)現的其他微生物一樣。
該論文的首席研究員、海洋科學助理教授布雷特貝克(Brett Baker)說:“這表明深海中蘊藏著巨大的未被探索的生物多樣性,微生物可以降解石油和其他有害化學物質?!霸诤5字?,現在有巨大的碳氫化合物氣體儲藏——包括甲烷、丙烷、丁烷等。-這些微生物可以防止溫室氣體釋放到大氣中?!?
這項新的研究代表了瓜伊馬斯盆地沉積物中有史以來最大的基因組樣本,由前UT博士后研究員尼娜多姆布羅夫斯基(Nina Dombrowski)和北卡羅來納大學教授安德烈亞斯特斯克(Andreas P. Teske)共同撰寫。
研究人員分析了地表以下2000米的沉積物,其中火山活動將溫度提高到約200攝氏度,并恢復了551個基因組,其中22個代表了生命之樹中的新條目。根據貝克的說法,這些新物種的基因差異足以代表生命之樹中的新分支,而有些物種則足以代表全新的大門。
自從達爾文在150多年前提出這個概念以來,生命之樹一直是人們試圖理解的東西,目前它仍然是這場運動的目標,”貝克說,他是較早提出這個概念的團隊的一員。迄今為止最全面的基因組生命樹?!眹L試畫一張樹狀圖對于理解生物學的各個方面非常重要。通過DNA測序和我們使用的計算機方法,我們越來越近,事物也在迅速擴張。"
世界上只有0.1%左右的微生物可以培養(yǎng),這意味著有數以千計甚至數百萬計的微生物有待發(fā)現。
貝克的團隊收集了自然沉積物和微生物樣本,然后從樣本中提取DNA,研究微生物群落與環(huán)境中可利用的營養(yǎng)物質之間的相互作用。研究人員對脫氧核糖核酸進行了測序,結合了每個基因組和每個生物體中的基因,并從數據中推斷出微生物是如何消耗不同的營養(yǎng)物質的。
“為此,我們試圖找到以前研究過的生物,并找到相似之處和不同之處,”目前在荷蘭皇家海洋研究所工作的多姆布羅夫斯基說?!斑@在一開始聽起來可能很容易,但實際上并不容易,因為我們發(fā)現的基因中有一半以上至今都沒有被描述和未知。”
用阿爾文號潛水器采集樣本,阿爾文號潛水器和發(fā)現泰坦尼克號一樣,因為微生物生活在極端環(huán)境中。與貝克和多姆布羅夫斯基合作的特斯克多年來一直在瓜伊馬斯盆地采集樣本,并與世界各地使用不同方法研究生命的科學家合作。
本月,貝克是阿爾文取樣小組的成員,該小組此前從未在該盆地進行過研究。
貝克說:“我們認為這可能只是瓜伊馬斯盆地多樣性的冰山一角?!八?,我們正在做更多的DNA測序,試圖掌握更多的東西。這篇論文實際上只是我們對這些事情和他們正在做的事情的第一個提示?!?
這項研究得到了美國能源部、斯隆基金會和國家科學基金會的支持。
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