導讀 人類基因組計劃產(chǎn)生了人類基因組的第一個序列，揭示了人類生物學的藍圖。二十年后，基因調(diào)控網(wǎng)絡領域描述了一個復雜的系統(tǒng)，其中數(shù)千個基因...
人類基因組計劃產(chǎn)生了人類基因組的第一個序列，揭示了人類生物學的藍圖。二十年后，基因調(diào)控網(wǎng)絡領域描述了一個復雜的系統(tǒng)，其中數(shù)千個基因相互調(diào)節(jié)以創(chuàng)建適當?shù)幕虮磉_動態(tài)。
然而，需要做更多的工作來充分理解這些網(wǎng)絡并確定它們的精確性質(zhì)。目前的方法要么間接估計基因調(diào)控，要么利用準確、直接但耗時的重復方法。
由京都大學領導的一個研究小組現(xiàn)已開發(fā)出一種高度準確的方法來半自動估計多細胞生物中的基因調(diào)控網(wǎng)絡。該方法涉及測量時間序列基因表達并應用該團隊專有的 RANGE 計算模型。該研究發(fā)表在《通訊生物學》雜志上。
京都大學生命與醫(yī)學科學研究所的通訊作者 Masato Ishikawa 表示：“RENGE 可能有助于識別細胞分化的關鍵因素，并有可能控制特定細胞的命運。”
研究人員可以使用相對準確的基因敲除方法來確定調(diào)節(jié)基因的表達，如果基因 A 被消除，那么 A 所調(diào)節(jié)的基因 B 就會暴露出來。
最新的單細胞 CRISPR 技術可以測量大規(guī)模個體基因敲除的表達變化，但有一個警告：直接和間接調(diào)控基因之間的區(qū)別尚不清楚。敲除一個基因不可避免地會影響網(wǎng)絡中順風基因的表達。
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