新的NIH計(jì)劃旨在發(fā)現(xiàn)和編目人體組織中體細(xì)胞鑲嵌的廣度
美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院正在啟動(dòng)一項(xiàng)新計(jì)劃,即共同基金的跨人體組織的體細(xì)胞鑲嵌(SMaHT)網(wǎng)絡(luò),旨在改變我們對(duì)全身細(xì)胞和組織中有多少遺傳變異的認(rèn)識(shí)。體細(xì)胞嵌合體是一種遺傳變異,當(dāng)我們的體細(xì)胞(非生殖)細(xì)胞在遺傳上彼此不同時(shí)就會(huì)出現(xiàn)。當(dāng)我們的一些細(xì)胞隨著時(shí)間的推移積累DNA變化時(shí),就會(huì)發(fā)生這種體細(xì)胞遺傳變異。體細(xì)胞鑲嵌可以改變細(xì)胞的功能,并可能影響人類發(fā)育、疾病、衰老和其他生理指標(biāo)。SMaHT網(wǎng)絡(luò)在五年內(nèi)獲得總計(jì)140.<>億美元的獎(jiǎng)金,等待資金到位,旨在發(fā)現(xiàn)和編目人體組織中體細(xì)胞鑲嵌的廣度。
"由于體細(xì)胞鑲嵌癥可以發(fā)生在我們身體的任何細(xì)胞類型中,它可能對(duì)我們的健康產(chǎn)生廣泛的影響。鑲嵌主義的廣度使得僅由一個(gè)NIH研究所或中心單獨(dú)解決的問(wèn)題變得笨拙,“NIH計(jì)劃協(xié)調(diào),規(guī)劃和戰(zhàn)略計(jì)劃部代理主任RobertEisinger博士說(shuō),該部門通過(guò)NIH共同基金為網(wǎng)絡(luò)提供財(cái)政支持和聯(lián)合領(lǐng)導(dǎo)。“這使得體細(xì)胞鑲嵌的研究非常適合NIH共同基金計(jì)劃,因?yàn)樗某闪⑹菫榱嗽贜IH的廣泛使命范圍內(nèi)促進(jìn)研究。
雖然體細(xì)胞鑲嵌癥可以發(fā)生在所有組織中,是癌癥的主要貢獻(xiàn)者,并且可以由外部暴露和一個(gè)人自己的內(nèi)部生物過(guò)程引起,但其對(duì)人類健康和疾病的全面影響尚不清楚。通過(guò)對(duì)正常人體組織中的體細(xì)胞鑲嵌進(jìn)行編目,SMaHT網(wǎng)絡(luò)將提供基礎(chǔ)知識(shí),使研究體細(xì)胞遺傳變異在人類發(fā)育和衰老中的作用,以及廣泛的疾病和紊亂,包括未診斷的疾病和大腦,肌肉,皮膚和免疫系統(tǒng)的疾病。此外,鑒于體細(xì)胞突變對(duì)癌癥的貢獻(xiàn),這一努力有可能支持拜登總統(tǒng)終結(jié)癌癥的目標(biāo),正如我們所知,這是癌癥登月計(jì)劃的一部分。
SMaHT網(wǎng)絡(luò)建立在其他具有里程碑意義的項(xiàng)目之上,如人類基因組計(jì)劃和共同基金的表觀基因組學(xué)計(jì)劃,克服了研究我們DNA部分的挑戰(zhàn),這些挑戰(zhàn)長(zhǎng)期以來(lái)阻礙了傳統(tǒng)的DNA測(cè)序工具。例如,細(xì)胞和組織特異性遺傳變化通常發(fā)生在罕見(jiàn)的細(xì)胞群中,并且可能存在于難以可靠表征的重復(fù)DNA區(qū)域中。此外,人類體細(xì)胞鑲嵌的程度可能受到遺傳變化的相對(duì)時(shí)間的影響。SMaHT網(wǎng)絡(luò)將開(kāi)發(fā)最先進(jìn)的技術(shù),以更好地檢測(cè)不同細(xì)胞類型和組織以及人類生命階段的體細(xì)胞嵌合體。
美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院國(guó)家神經(jīng)疾病和中風(fēng)研究所(NINDS)主任WalterKoroshetz博士指出,“隨著時(shí)間的推移,識(shí)別體細(xì)胞突變的技術(shù),包括由于轉(zhuǎn)座元件或所謂的'跳躍基因'的運(yùn)動(dòng)引起的突變,將導(dǎo)致對(duì)年齡相關(guān)疾病的新理解。
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NIH已經(jīng)頒發(fā)了22個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng)來(lái)建立SMaHT網(wǎng)絡(luò),其組成部分包括:
數(shù)據(jù)分析中心,用于創(chuàng)建這種體細(xì)胞遺傳變異的目錄,以及一個(gè)數(shù)據(jù)工作臺(tái),以可視化和分析變異,該變異將與現(xiàn)有的遺傳工具和數(shù)據(jù)庫(kù)集成
工具開(kāi)發(fā)項(xiàng)目,以創(chuàng)建新的DNA測(cè)序和分析技術(shù),以應(yīng)對(duì)檢測(cè)重復(fù)DNA序列區(qū)域和小細(xì)胞群中發(fā)生的罕見(jiàn)遺傳變化的挑戰(zhàn)
組織中心,負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)網(wǎng)絡(luò)的活動(dòng)并將網(wǎng)絡(luò)資源分配給研究界。
為了確保多樣化的代表性,SMaHT網(wǎng)絡(luò)將從包括不同祖先和不同生命階段的人類供體庫(kù)中抽取組織樣本。從每個(gè)供體收集的一組通用組織將代表全身的不同組織類型,可能包括來(lái)自大腦、血液、皮膚、肌肉、結(jié)腸、脾臟、子宮、輸精管、卵巢和睪丸的樣本。
SMaHT網(wǎng)絡(luò)是由NIH共同基金,國(guó)家人類基因組研究所,國(guó)家藥物濫用研究所,國(guó)家環(huán)境健康科學(xué)研究所,國(guó)家心理健康研究所和NINDS合作管理的NIH范圍的努力。
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