隨著越來越多的癌癥患者對(duì)其腫瘤進(jìn)行基因組分析,以及更多針對(duì)基因組改變的療法進(jìn)入臨床試驗(yàn),將患者與他們有資格參加的試驗(yàn)聯(lián)系起來的任務(wù)尤其具有挑戰(zhàn)性。Dana-Farber Cancer Institute 開發(fā)的計(jì)算機(jī)平臺(tái)使匹配過程變得更容易和更快,其設(shè)計(jì)師在一項(xiàng)新研究中報(bào)告說。
該平臺(tái)名為 MatchMiner,可幫助臨床醫(yī)生和臨床研究人員根據(jù)患者腫瘤的基因改變找到患者和靶向治療試驗(yàn)之間的潛在匹配。在 Dana-Farber 的五年期間,它幫助獲得了大約五分之一的同意加入 MatchMiner 中具有基因組數(shù)據(jù)的患者的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)試驗(yàn)。發(fā)表在npj Precision Oncology上的該研究的作者發(fā)現(xiàn),它還將患者納入此類試驗(yàn)的過程加快了 20% 以上。
“對(duì)患者腫瘤進(jìn)行基因組改變分析已成為癌癥治療的一個(gè)廣泛部分,特別是當(dāng)針對(duì)這些改變的新藥進(jìn)入臨床試驗(yàn)或被批準(zhǔn)為癌癥治療方法時(shí),”該研究的共同主要作者 Tali Mazor 博士說。與 Dana-Farber 的同事 Harry Klein 博士共同撰寫的論文。“不斷增長(zhǎng)的基因組數(shù)據(jù)和越來越多的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)試驗(yàn)相結(jié)合,造成了一種脫節(jié):為每位患者找到合適的試驗(yàn)可能是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。MatchMiner 有助于彌合這一差距。”
該平臺(tái)由 Dana-Farber 的 Knowledge Systems Group 開發(fā),由 Ethan Cerami 博士和醫(yī)學(xué)博士、公共衛(wèi)生碩士 Michael Hassett 領(lǐng)導(dǎo),借鑒了 Dana-Farber 在基因組分析和臨床研究方面的廣泛項(xiàng)目。在過去的十年中,該研究所的 40,000 多名患者對(duì)他們的腫瘤組織進(jìn)行了分析,以了解 400 多個(gè)癌癥相關(guān)基因的變化。該研究所及其合作伙伴領(lǐng)導(dǎo)或參與了數(shù)千項(xiàng)臨床試驗(yàn),其中包括自 2017 年以來約 450 項(xiàng)涉及靶向治療的臨床試驗(yàn)。2016 年推出的 MatchMiner 將這些系統(tǒng)連接起來,以幫助將患者與適當(dāng)?shù)脑囼?yàn)相匹配。
“腫瘤學(xué)家或其他臨床醫(yī)生可以使用 MatchMiner 來查找個(gè)體患者的試驗(yàn)選擇,”Klein 評(píng)論道。“或者,試驗(yàn)團(tuán)隊(duì)可以使用它來識(shí)別潛在的試驗(yàn)參與者,方法是設(shè)置一個(gè)基因組過濾器,篩選特定基因組標(biāo)準(zhǔn)的候選人。”
與大多數(shù)其他為單個(gè)癌癥中心設(shè)計(jì)的匹配平臺(tái)不同,MatchMiner 是開源的,可以被其他機(jī)構(gòu)采用。隨著 Dana-Farber 的新試驗(yàn)開始,策展人會(huì)審查它們,以確定它們是否應(yīng)該包含在 MatchMiner 中,以確保平臺(tái)是最新的。截至 2021 年 3 月,354 項(xiàng)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)試驗(yàn)被整合到 MatchMiner 中。
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