在一項(xiàng)首創(chuàng)的實(shí)驗(yàn)中，研究人員確定了 127 個基因與免疫疾病之間的聯(lián)系，為 T 細(xì)胞激活過程中基因活動的序列和時間提供了新的見解，這是調(diào)節(jié)身體免疫反應(yīng)的關(guān)鍵過程。
該研究由 Open Targets、威康桑格研究所和葛蘭素史克的研究人員領(lǐng)導(dǎo)，于今天(2022 年 5 月 26 日)在Nature Genetics上發(fā)表。這是一項(xiàng) 3 年研究努力的結(jié)果，它首次表明在 T 細(xì)胞激活的不同階段，許多與疾病相關(guān)的變體是活躍的，為指導(dǎo)開發(fā)針對類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等免疫疾病的新療法提供了關(guān)鍵信息，類型-1 糖尿病和克羅恩病。
T細(xì)胞是一組有助于管理人體免疫系統(tǒng)的白細(xì)胞。當(dāng) T 細(xì)胞發(fā)生故障時，它們會導(dǎo)致嚴(yán)重的免疫缺陷，使患者面臨感染的高風(fēng)險(xiǎn)，以及更常見的自身免疫性疾病，如 1 型糖尿病和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎，身體會對自身細(xì)胞發(fā)起攻擊。
T 細(xì)胞活化是免疫系統(tǒng)對感染作出反應(yīng)的第一步。在分子水平上繪制這個激活周期對于了解它可能出錯的地方以及在哪些點(diǎn)治療干預(yù)可以影響這個過程至關(guān)重要。但迄今為止，僅繪制了有限的激活序列快照，例如在單個時間點(diǎn)查看細(xì)胞。這些快照技術(shù)也無法捕獲每個階段存在的細(xì)胞亞型的多樣性。Open Targets 之前的研究表明，與免疫疾病相關(guān)的 DNA 的某些變異與 T 細(xì)胞的激活過程有關(guān)。
在這項(xiàng)新研究中，威康桑格研究所和葛蘭素史克的研究人員使用單細(xì)胞 RNA 測序技術(shù)對超過 650,000 個單個細(xì)胞進(jìn)行了分析，以繪制 T 細(xì)胞激活過程中每個細(xì)胞亞型的基因活動時間。他們確定了受 DNA 變化調(diào)控的基因，這些基因在 T 細(xì)胞激活期間從靜止?fàn)顟B(tài)到三個不同時間點(diǎn)在每個細(xì)胞中打開或關(guān)閉。
該團(tuán)隊(duì)確定了超過 6,400 個參與激活過程的基因。通過將他們的數(shù)據(jù)與 13 種免疫疾病的已知遺傳變異進(jìn)行比較，他們能夠找到與這些疾病相關(guān)的 127 個基因，其中一些僅在以前未研究過的特定時間點(diǎn)出現(xiàn)。
來自 Wellcome Sanger 研究所的該研究的第一作者 Blagoje Soskic 博士說：“通過分析 T 細(xì)胞激活過程中的多個時間點(diǎn)，我們的研究強(qiáng)調(diào)了基因調(diào)控可以針對特定的細(xì)胞狀態(tài)。至關(guān)重要的是，我們能夠?qū)?DNA 變異與特定基因(尤其是細(xì)胞類型)在激活過程中不同時間的活性變化聯(lián)系起來。這種前所未有的粒度是更好地了解 T 細(xì)胞激活的關(guān)鍵，為尋求新療法提供更深入的數(shù)據(jù)用于免疫疾病。”
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