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結構生物與計算設計相結合以創(chuàng)建抗癌劑

Paul Scherrer 研究所 PSI 和理工學院 IIT 的研究人員開發(fā)了一種新物質(zhì),可以使細胞骨架中的蛋白質(zhì)失效,導致細胞死亡。通過這種方式,這種物質(zhì)可以防止例如腫瘤的生長。為此,研究人員將結構生物學方法與活性劑的計算設計相結合。該研究發(fā)表在《 Angewandte Chemie International Edition 》雜志上。

細胞骨架,也稱為細胞骨架,作為線狀蛋白質(zhì)結構的動態(tài)網(wǎng)絡遍布我們所有的細胞。它賦予細胞形態(tài),幫助運輸?shù)鞍踪|(zhì)和更大的細胞成分,并在細胞分裂中發(fā)揮關鍵作用。中心構件是蛋白質(zhì)微管蛋白。它自身排列成管狀結構,即微管細絲。

附著在細胞骨架上的活性劑是最有效的抗癌藥物之一。它們阻斷微管蛋白,從而防止腫瘤中的細胞分裂。PSI 研究人員與位于熱那亞的理工學院合作,現(xiàn)已開發(fā)出另一種使微管蛋白失效的強效物質(zhì)。他們稱它為“Todalam”。

“Todalam 阻止微管蛋白以微管絲的形式排列,”第一作者 Tobias Mühlethaler 解釋說,他在 PSI 的博士研究中共同設計和研究了該物質(zhì)。“這種蛋白質(zhì)就像冷凍在一個不適合微管的結構中一樣。”

設計合理

開發(fā)新藥通常有兩種不同的方法:研究人員可以測試大量分子以找出看起來有希望的分子,或者他們可以專門設計能夠達到預期效果的化學分子。PSI 和 IIT 研究人員選擇了第二條路徑,這通常更困難。

在這樣做的過程中,他們能夠建立自己的基礎,研究他們已經(jīng)在微管蛋白中找到了分子可以特別好對接的位置。這些是所謂的結合口袋,他們發(fā)現(xiàn)了 27 個。此外,研究人員還確定了 56 個與這些位點結合的片段。這項工作也早先在Angewandte Chemie 國際版上發(fā)表過。

在基于這項先前工作的當前研究中,研究人員最初選擇了一個新發(fā)現(xiàn)的微管蛋白結合口袋。他們使用計算設計將三個優(yōu)先??吭谶@一點上的分子片段的結構組合成一個單一的化合物,然后他們在實驗室合成了它。“通過將三個片段組合成一個分子,我們希望增強效果,因為新分子可以更好地填充結合口袋,”PSI 生物分子研究實驗室負責人 Michel Steinmetz 說。

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