eDNA 測序將使科學家能夠在不捕魚的情況下探索亞馬遜地區(qū)的魚類多樣性

在巴西、哥倫比亞和秘魯邊界的 Javari 河流域進行的一次科學考察表明，使用環(huán)境 DNA 測序來調(diào)查亞馬遜地區(qū)的魚類多樣性是可行的。eDNA 方法包括提取水樣中存在的 DNA 分子并通過遺傳標記識別它們所屬的物種。

發(fā)表在《科學報告》雜志上的一篇關于這項研究的文章還討論了該技術在研究亞馬遜河這樣高度多樣化的環(huán)境方面的局限性。

“我們需要繼續(xù)通過傳統(tǒng)方法捕捉和識別動物，以創(chuàng)建遺傳材料庫。它們將作為比較水樣中發(fā)現(xiàn)的任何物質的參考。美國史密森學會國家自然歷史博物館的研究助理卡洛斯·大衛(wèi)·德桑塔納說，隨著技術的進步，幾年后我們可能無需捕捉就能了解一個地方存在的所有魚類。州和文章的第一作者。

這項研究是該項目的一部分，“多樣性和電鰻目的進化”，由FAPESP支持和領導Naércio梅內(nèi)塞斯在圣保羅動物博物館(MZ-USP)在巴西的大學教授。“從水樣中提取 DNA 產(chǎn)生了非常有利于保護環(huán)境的期望，因為收集水生動物樣本的常用方法包括使用網(wǎng)和其他具有負面影響的漁具，”梅內(nèi)塞斯說， ——文章作者。

這組研究人員在 Javari 河上度過了 18 天，在他們收集魚類標本的 46 個地點中的三個地點收集水樣。所代表的物種數(shù)量達到了驚人的 443 個，其中 60 個是科學上的新物種。

在收集用于 eDNA 分析的水的地點，使用傳統(tǒng)方法捕獲了 201 個物種。然而，只有 58 個，即總數(shù)的 26%，通過 eDNA 分析在物種水平上得到了精確鑒定。

“一個可能的解釋是數(shù)據(jù)庫中缺乏可用于比較的參考遺傳材料。此外，這些地方的許多物種都是全新的，在使用傳統(tǒng)技術之前從未被發(fā)現(xiàn)，”圣保羅聯(lián)邦大學海洋科學研究所 (IMAR-UNIFESP) 教授Gislene Torrente-Vilara 說，文章的共同作者。

Torrente-Vilara 作為亞馬遜魚類項目的一部分領導了這次探險，這是一項由 FAPESP 支持的國際合作，導致對該地區(qū)魚類分布的新認識(更多信息見：agencia.fapesp.br/31956)。

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