Aging-US：肝細胞癌的樞紐候選網(wǎng)絡(luò)

Aging-US發(fā)表了“與環(huán)狀 RNA 相互作用的 RNA 結(jié)合蛋白和肝細胞癌樞紐候選網(wǎng)絡(luò)的鑒定”，其中報告了來自臨床蛋白質(zhì)組學腫瘤分析聯(lián)盟、癌癥基因組圖譜和國際癌癥基因組的 17 種 DERBP，在 HCC 中通常失調(diào)聯(lián)盟項目被用來構(gòu)建 RBP-circRNA 網(wǎng)絡(luò)。

此外，基因集富集分析表明，失調(diào)的 TARDBP 可能參與了一些與 HCC 發(fā)病機制相關(guān)的通路。

因此，基于 TARDBP 生成了一個集線器 RBP-circRNA 網(wǎng)絡(luò)。

RNA 免疫沉淀和 RNA 下拉證實 hsa_circ_0004913 與 TARDBP 結(jié)合。

這些研究結(jié)果發(fā)表在Aging-US 上，表明某種 RBP-circRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能參與 HCC 的發(fā)病機制，這為 HCC 的研究機制和生物標志物鑒定提供了新的見解。

南方醫(yī)科大學陳玉涵博士說：“肝細胞癌(HCC)是最常見的原發(fā)性肝癌類型。”

先前的研究表明，circRNAs可以作為RNA結(jié)合蛋白的海綿，同時RBPs也能夠參與反向剪接。因此，與 RBPs 的相互作用也可以被視為探索 circRNAs 功能的關(guān)鍵因素。

然而，關(guān)于 RBP-circRNA 相互作用對 HCC 的影響的研究很少，需要更多的探索。

在這項研究中，作者從基因表達綜合數(shù)據(jù)庫中篩選出 HCC 病例中差異表達的 circRNA，并預測了與 DEcircRNA 結(jié)合的 RBP。

在評估來自臨床蛋白質(zhì)組學腫瘤分析聯(lián)盟、國際癌癥基因組聯(lián)盟和癌癥基因組圖譜項目的 HCC 中 RBPs 的表達水平后，他們利用 17 個常見的 DERBPs 構(gòu)建了 HCC 中的 RBP-circRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

這些發(fā)現(xiàn)表明某些RBP-circRNA網(wǎng)絡(luò)可能與HCC密切相關(guān)，為HCC的研究機制提供了思路。

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