IRB巴薩羅那和亞馬遜聯(lián)合開發(fā)計(jì)算工具對(duì)抗新冠
目前,與感染相關(guān)的科學(xué)文章超過1萬篇。事實(shí)上,最近幾周,抗擊新冠的研究已經(jīng)加快,已經(jīng)發(fā)表了4000多篇關(guān)于潛在疫苗、療法和治療的新學(xué)術(shù)論文。手動(dòng)管理如此大量的信息將是困難的,因此這項(xiàng)迫切需要的研究無法足夠快地推廣。由ICREA研究員Patrick Aloy領(lǐng)導(dǎo)的IRB Barcelona結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室與亞馬遜合作開發(fā)了一種計(jì)算工具,可以加快這一過程。使用人工智能,該工具將“閱讀”所有這些文章,并提取與所研究的分子和治療方法相關(guān)的所有相關(guān)信息。
通過對(duì)最相關(guān)的科學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行有限的回顧,巴塞羅那IRB的研究人員已經(jīng)確定了150種具有不同水平實(shí)驗(yàn)證據(jù)的化合物,這些化合物可能具有抗新冠活性。
我們現(xiàn)在需要的是一個(gè)利用新冠介紹其成果的研究團(tuán)隊(duì)。新分子每天會(huì)自動(dòng)整合一次,這樣整個(gè)科學(xué)界都會(huì)有更新的數(shù)據(jù),這將有助于避免重復(fù),產(chǎn)生新的假說,從而有助于找到明確的治療方法。"
ICREA研究員帕特里克阿洛伊
快速合作發(fā)現(xiàn)藥物。
化學(xué)家是一種計(jì)算工具,可以提供一百萬個(gè)具有藥理潛力的分子的信息。IRB巴塞羅那集團(tuán)研究員、《科學(xué)》雜志第一作者、Iique Barcelona的Miquel Duran表示,“Chemical Checker旨在處理和編碼關(guān)于不同化合物對(duì)活生物體影響的復(fù)雜數(shù)據(jù),從而將其納入新的人工智能技術(shù)?!毖芯?。
巴薩羅那IRB致力于新冠的研究。
僅在一周內(nèi),Aloy的實(shí)驗(yàn)室就與亞馬遜建立了合作關(guān)系,從而對(duì)生物信息學(xué)工具進(jìn)行了微調(diào)。亞馬遜搜索科學(xué)和人工智能集團(tuán)的雨果薩拉戈薩說:“我們很高興在為新冠提供的藥物發(fā)現(xiàn)服務(wù)中使用人工智能功能?!眮嗰R遜在文本挖掘、機(jī)器學(xué)習(xí)和自然語言理解方面的經(jīng)驗(yàn)使科學(xué)文章的自動(dòng)分析能夠快速集成到Chemical Checker中?!芭c亞馬遜的合作對(duì)于快速啟動(dòng)和運(yùn)行該工具至關(guān)重要。沒有它的AWS云計(jì)算和文本處理功能,這將是不可能的,”Aloy說。
結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室也參與了歐洲項(xiàng)目RiPCoN,該項(xiàng)目致力于為擴(kuò)展的人類蛋白質(zhì)識(shí)別病毒。該項(xiàng)目旨在尋找能夠調(diào)節(jié)病毒活性并防止其復(fù)制的藥物(已經(jīng)上市或正在臨床試驗(yàn)中)。
巴薩羅那內(nèi)部評(píng)級(jí)機(jī)構(gòu)也在致力于與新冠相關(guān)的其他項(xiàng)目。一個(gè)致力于開發(fā)一種快速簡單的診斷測(cè)試來檢測(cè)病毒,而另一個(gè)致力于為新冠開發(fā)噴霧療法。另一個(gè)項(xiàng)目側(cè)重于尋找治療急性呼吸窘迫綜合征的方法,以降低新冠的死亡率,這是該病毒死亡的主要原因。
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