IRB巴薩羅那和亞馬遜聯(lián)合開發(fā)計算工具對抗新冠
目前,與感染相關的科學文章超過1萬篇。事實上,最近幾周,抗擊新冠的研究已經(jīng)加快,已經(jīng)發(fā)表了4000多篇關于潛在疫苗、療法和治療的新學術論文。手動管理如此大量的信息將是困難的,因此這項迫切需要的研究無法足夠快地推廣。由ICREA研究員Patrick Aloy領導的IRB Barcelona結構生物信息學和網(wǎng)絡生物學實驗室與亞馬遜合作開發(fā)了一種計算工具,可以加快這一過程。使用人工智能,該工具將“閱讀”所有這些文章,并提取與所研究的分子和治療方法相關的所有相關信息。
通過對最相關的科學文獻進行有限的回顧,巴塞羅那IRB的研究人員已經(jīng)確定了150種具有不同水平實驗證據(jù)的化合物,這些化合物可能具有抗新冠活性。
我們現(xiàn)在需要的是一個利用新冠介紹其成果的研究團隊。新分子每天會自動整合一次,這樣整個科學界都會有更新的數(shù)據(jù),這將有助于避免重復,產(chǎn)生新的假說,從而有助于找到明確的治療方法。"
ICREA研究員帕特里克阿洛伊
快速合作發(fā)現(xiàn)藥物。
化學家是一種計算工具,可以提供一百萬個具有藥理潛力的分子的信息。IRB巴塞羅那集團研究員、《科學》雜志第一作者、Iique Barcelona的Miquel Duran表示,“Chemical Checker旨在處理和編碼關于不同化合物對活生物體影響的復雜數(shù)據(jù),從而將其納入新的人工智能技術?!毖芯俊?
巴薩羅那IRB致力于新冠的研究。
僅在一周內,Aloy的實驗室就與亞馬遜建立了合作關系,從而對生物信息學工具進行了微調。亞馬遜搜索科學和人工智能集團的雨果薩拉戈薩說:“我們很高興在為新冠提供的藥物發(fā)現(xiàn)服務中使用人工智能功能?!眮嗰R遜在文本挖掘、機器學習和自然語言理解方面的經(jīng)驗使科學文章的自動分析能夠快速集成到Chemical Checker中?!芭c亞馬遜的合作對于快速啟動和運行該工具至關重要。沒有它的AWS云計算和文本處理功能,這將是不可能的,”Aloy說。
結構生物信息學和網(wǎng)絡生物學實驗室也參與了歐洲項目RiPCoN,該項目致力于為擴展的人類蛋白質識別病毒。該項目旨在尋找能夠調節(jié)病毒活性并防止其復制的藥物(已經(jīng)上市或正在臨床試驗中)。
巴薩羅那內部評級機構也在致力于與新冠相關的其他項目。一個致力于開發(fā)一種快速簡單的診斷測試來檢測病毒,而另一個致力于為新冠開發(fā)噴霧療法。另一個項目側重于尋找治療急性呼吸窘迫綜合征的方法,以降低新冠的死亡率,這是該病毒死亡的主要原因。
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