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利用尖端晶體學揭示蛋白質(zhì)變形的秘密

使用高壓和高溫的新晶體學實驗揭示蛋白質(zhì)如何改變形狀,可以促進新藥物的開發(fā)。

蛋白質(zhì)通過與代謝物或其他蛋白質(zhì)結合來完成任務,從而在我們體內(nèi)執(zhí)行生化功能。為了成功地做到這一點,蛋白質(zhì)分子通常會發(fā)生形狀變化,以實現(xiàn)執(zhí)行復雜、精確的化學過程所需的特異性結合相互作用。

蛋白質(zhì)結構研究

更好地了解蛋白質(zhì)的形狀將為研究人員提供阻止或治療疾病的重要見解,但目前揭示這些動態(tài)三維形式的方法為科學家提供的信息有限。

為了解決這一知識差距,紐約市立大學研究生中心高級科學研究中心 (CUNY ASRC) 的一個團隊設計了一項實驗,測試使用高溫與高壓進行 X 射線晶體學成像是否會揭示不同的形狀。該團隊的工作結果將于今天(1 月 12 日)發(fā)表在《通訊生物學》雜志上。

蛋白質(zhì)靈活性

這些水分子的位置對于理解蛋白質(zhì)的靈活性以及類藥物分子影響蛋白質(zhì)結構和功能的能力通常很重要。在這項研究中,在不同的實驗擾動下,例如高溫(紅色)、高壓(綠色)或默認條件(藍色),蛋白質(zhì)表面出現(xiàn)了不同的獨特水,為這些問題提供了補充見解。圖片來源:Ali Ebrahim 和 Liliana Guerrero

Daniel Keedy 博士的研究見解

“蛋白質(zhì)結構不會靜止不動;“它們就像舞者一樣在幾種相似的形狀之間變換。”該研究的首席研究員、紐約市立大學 ASRC 結構生物學計劃教授、紐約城市學院和紐約市立大學化學和生物化學教授 Daniel Keedy 博士說。研究生中心。“不幸的是,現(xiàn)有的觀察蛋白質(zhì)的方法只能揭示一種形狀,或者暗示存在多種形狀,但沒有提供具體細節(jié)。我們想看看刺探蛋白質(zhì)的不同方式是否能讓我們更詳細地了解它的形狀變化。”

實驗和觀察

在他們的實驗中,研究小組獲得了 STEP 晶體,也稱為 PTPN5(一種用于治療包括阿爾茨海默病在內(nèi)的多種疾病的藥物靶蛋白),并使用高壓(地球大氣壓的 2,000 倍)或高溫(身體溫度)攪拌它們。溫度),這兩者都與大氣壓和低溫(-280 ° F,-173 ° C)下的典型晶體學實驗有很大不同。研究人員使用 X 射線晶體學觀察樣品,觀察到高溫和高壓對蛋白質(zhì)有不同的影響,揭示出不同的形狀。

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