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科學(xué)家揭開關(guān)鍵調(diào)控基因的新起源故事

導(dǎo)讀 Polycomb 抑制復(fù)合物 2 (PRC2) 最初在幾十年前在果蠅中發(fā)現(xiàn),被發(fā)現(xiàn)是發(fā)育基因的關(guān)鍵控制器。隨后的研究表明,PRC2 通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)...

Polycomb 抑制復(fù)合物 2 (PRC2) 最初在幾十年前在果蠅中發(fā)現(xiàn),被發(fā)現(xiàn)是發(fā)育基因的關(guān)鍵控制器。隨后的研究表明,PRC2 通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)來抑制特定基因的表達。

當發(fā)現(xiàn) PRC2 在不發(fā)生發(fā)育的單細胞生物體中活躍時,對 PRC2 祖先功能(主要在發(fā)育過程中控制基因)的最初理解受到了挑戰(zhàn)。

PRC2 的祖先角色和演變

關(guān)于 PRC2 最初作用的第一個線索來自對紅藻的研究,該研究發(fā)現(xiàn) PRC2 在轉(zhuǎn)座子(在基因組中移動的跳躍基因)上留下了甲基化標記。Frederic Berger 和他在格雷戈爾·孟德爾分子植物生物學(xué)研究所 (GMI) 的研究小組決定遵循這一線索,并與柏林自由大學(xué)、劍橋大學(xué)、南特大學(xué)、國家遺傳學(xué)研究所(日本)的研究人員進行國際合作)和莫納什大學(xué)研究了 PRC2 在一系列真核生物中的作用。

為了了解 PRC2 在真核生物祖先中的作用,研究人員研究了三個相距甚遠的真核生物譜系的基因組:植物、SAR 和后康生物(人類和真菌所屬的譜系)。

所有這些真核生物都含有轉(zhuǎn)座子,即可以從DNA中切除自身并插入到新位置的移動遺傳元件,這對基因組穩(wěn)定性構(gòu)成潛在威脅,因此必須沉默轉(zhuǎn)座子。在突變硅藻、苔蘚植物和紅藻中,PRC2 活性的去除導(dǎo)致轉(zhuǎn)座元件沉默的喪失。

“這些發(fā)現(xiàn)表明 PRC2 抑制這些遙遠譜系中的轉(zhuǎn)座因子,這將其定義為所有三個譜系的祖先中出現(xiàn)的功能。PRC2的起源可能主要是為了保護基因組免受轉(zhuǎn)座子的入侵。這種祖先功能是范式的深刻變化,”GMI 小組組長、該研究的通訊作者 Frederic Berger 說。

然而,在進化過程中,PRC2 的功能逐漸從抑制轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)變?yōu)橐种频鞍踪|(zhì)編碼基因,這也是其最初描述的作用。在陸地植物中,研究人員發(fā)現(xiàn)“化石 TE”仍然是 PRC2 的目標,然后 PRC2 就會沉默附近的基因。

Berger 小組的博士后研究員、該研究的第一作者 Tetsuya Hisanaga 解釋說:“在開花植物中,比如最近才進化的擬南芥,TE 的殘余物仍然存在,并招募 PRC2 來沉默附近的基因。” “我們假設(shè)在擬南芥中,一些 TE 已經(jīng)被馴化,成為參與調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)編碼基因的元件。”

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