新研究表征腸道病毒組

華盛頓特區(qū) - 2021 年 10 月 19 日- 一項新研究為全球不斷增加的人類腸道病毒組添加了許多以前未表征的病毒基因組和基因。該研究發(fā)表在美國微生物學會的開放獲取期刊mSystems 上，將證明有助于研究腸道病毒組在人類健康和疾病中的作用。

“人類腸道病毒組仍未得到充分探索，許多新病毒有待發(fā)現(xiàn)，其中一些可能對影響人類健康和疾病的過程產(chǎn)生重要影響，”該研究的首席研究員、該研究的教授 Jelle Matthijnssens 博士說。微生物學、免疫學和移植系，Rega 研究所，臨床和流行病學病毒學部，病毒宏基因組學實驗室，KU Leuven，Leuven，比利時。

人類腸道包含一個復雜的微生物生態(tài)系統(tǒng)，其中細菌已被廣泛研究。Matthijnssens 博士說，對腸道病毒的研究滯后。MicrobLiver 項目的目標是了解宿主與人類腸道微生物組之間的相互作用以及腸道-肝臟軸在酒精性和非酒精性脂肪肝疾病早期的作用。“在 MicrobLiver 項目的框架內(nèi)，我們的目標是生成病毒基因組目錄，該目錄可用于后續(xù)對酒精性和非酒精性脂肪性肝病早期人群的研究，”Matthijnssens 博士說。

在這項新研究中，研究人員使用來自 204 名丹麥受試者的 254 份糞便樣本來生成丹麥腸道病毒目錄 (DEVoC)。兒科隊列包括 50 名體重指數(shù) (BMI) 高于第 90個百分位數(shù)的兒童和青少年(6-18 歲)，以及 50 名年齡和性別匹配的健康對照。成人隊列(34-76 歲)包括 52 名酒精相關(guān)肝病患者和 52 名性別、BMI 和年齡匹配的健康對照。

研究人員使用新型病毒富集技術(shù) (NetoVIR) 協(xié)議從糞便樣本中純化所有病毒顆粒，并使用深度測序技術(shù)對其基因組進行測序。(NetoVir 使研究人員能夠為下一代測序腸道病毒組學研究獲得快速、可重復、高通量的樣品制備方案。)

此外，他們使用先進的生物信息學工具識別了近 13,000 個(部分)病毒基因組，其中許多是新的，并且不存在于公共數(shù)據(jù)庫中。

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